Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc92Q8VDN4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc92Q8VDN4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc92Q8VDN4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc92Q8VDN4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc92Q8VDN4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc92Q8VDN4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc92Q8VDN4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc92Q8VDN4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc92Q8VDN4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc92Q8VDN4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc92Q8VDN4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc92Q8VDN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc92Q8VDN4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc92Q8VDN4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc92Q8VDN4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc92Q8VDN4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc92Q8VDN4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc92Q8VDN4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc92Q8VDN4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc92Q8VDN4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc92Q8VDN4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc92Q8VDN4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc92Q8VDN4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc92Q8VDN4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc92Q8VDN4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc92Q8VDN4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc92Q8VDN4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc92Q8VDN4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc92Q8VDN4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc92Q8VDN4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc92Q8VDN4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc92Q8VDN4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc92Q8VDN4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc92Q8VDN4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc92Q8VDN4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc92Q8VDN4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc92Q8VDN4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc92Q8VDN4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc92Q8VDN4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc92Q8VDN4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc92Q8VDN4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc92Q8VDN4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc92Q8VDN4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc92Q8VDN4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc92Q8VDN4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc92Q8VDN4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc92Q8VDN4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc92Q8VDN4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc92Q8VDN4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc92Q8VDN4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc92Q8VDN4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc92Q8VDN4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc92Q8VDN4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc92Q8VDN4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc92Q8VDN4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc92Q8VDN4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc92Q8VDN4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc92Q8VDN4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc92Q8VDN4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc92Q8VDN4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc92Q8VDN4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc92Q8VDN4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc92Q8VDN4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc92Q8VDN4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc92Q8VDN4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc92Q8VDN4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc92Q8VDN4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc92Q8VDN4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc92Q8VDN4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc92Q8VDN4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc92Q8VDN4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc92Q8VDN4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc92Q8VDN4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc92Q8VDN4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc92Q8VDN4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc92Q8VDN4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc92Q8VDN4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc92Q8VDN4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc92Q8VDN4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc92Q8VDN4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc92Q8VDN4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc92Q8VDN4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc92Q8VDN4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc92Q8VDN4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc92Q8VDN4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc92Q8VDN4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc92Q8VDN4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc92Q8VDN4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc92Q8VDN4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms