Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GcaQ8VC88 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GcaQ8VC88 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GcaQ8VC88 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GcaQ8VC88 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GcaQ8VC88 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GcaQ8VC88 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GcaQ8VC88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GcaQ8VC88 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GcaQ8VC88 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GcaQ8VC88 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GcaQ8VC88 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GcaQ8VC88 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GcaQ8VC88 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GcaQ8VC88 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GcaQ8VC88 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GcaQ8VC88 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GcaQ8VC88 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GcaQ8VC88 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GcaQ8VC88 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GcaQ8VC88 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GcaQ8VC88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GcaQ8VC88 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GcaQ8VC88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GcaQ8VC88 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GcaQ8VC88 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GcaQ8VC88 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GcaQ8VC88 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GcaQ8VC88 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GcaQ8VC88 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GcaQ8VC88 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GcaQ8VC88 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GcaQ8VC88 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GcaQ8VC88 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GcaQ8VC88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GcaQ8VC88 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GcaQ8VC88 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GcaQ8VC88 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GcaQ8VC88 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcaQ8VC88 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GcaQ8VC88 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GcaQ8VC88 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GcaQ8VC88 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GcaQ8VC88 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcaQ8VC88 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GcaQ8VC88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GcaQ8VC88 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GcaQ8VC88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GcaQ8VC88 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GcaQ8VC88 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GcaQ8VC88 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GcaQ8VC88 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GcaQ8VC88 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GcaQ8VC88 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GcaQ8VC88 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GcaQ8VC88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GcaQ8VC88 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GcaQ8VC88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GcaQ8VC88 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GcaQ8VC88 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GcaQ8VC88 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GcaQ8VC88 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GcaQ8VC88 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GcaQ8VC88 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GcaQ8VC88 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GcaQ8VC88 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GcaQ8VC88 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GcaQ8VC88 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GcaQ8VC88 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GcaQ8VC88 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GcaQ8VC88 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GcaQ8VC88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GcaQ8VC88 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GcaQ8VC88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GcaQ8VC88 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GcaQ8VC88 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GcaQ8VC88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GcaQ8VC88 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcaQ8VC88 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcaQ8VC88 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcaQ8VC88 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcaQ8VC88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcaQ8VC88 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcaQ8VC88 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcaQ8VC88 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcaQ8VC88 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GcaQ8VC88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GcaQ8VC88 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcaQ8VC88 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms