Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrtm1Q8K377 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrtm1Q8K377 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrtm1Q8K377 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrtm1Q8K377 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrtm1Q8K377 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrtm1Q8K377 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrtm1Q8K377 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrtm1Q8K377 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrtm1Q8K377 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrtm1Q8K377 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrtm1Q8K377 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrtm1Q8K377 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrtm1Q8K377 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrtm1Q8K377 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrtm1Q8K377 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrtm1Q8K377 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrtm1Q8K377 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrrtm1Q8K377 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrrtm1Q8K377 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrtm1Q8K377 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrtm1Q8K377 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrtm1Q8K377 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrtm1Q8K377 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrtm1Q8K377 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrtm1Q8K377 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrtm1Q8K377 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrtm1Q8K377 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrtm1Q8K377 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrtm1Q8K377 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrtm1Q8K377 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrtm1Q8K377 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrtm1Q8K377 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrtm1Q8K377 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrtm1Q8K377 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrtm1Q8K377 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrtm1Q8K377 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrtm1Q8K377 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrtm1Q8K377 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrtm1Q8K377 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrtm1Q8K377 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrtm1Q8K377 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrtm1Q8K377 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrtm1Q8K377 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrtm1Q8K377 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrtm1Q8K377 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrtm1Q8K377 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrtm1Q8K377 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrtm1Q8K377 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrtm1Q8K377 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrtm1Q8K377 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrtm1Q8K377 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrtm1Q8K377 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrtm1Q8K377 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrtm1Q8K377 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrtm1Q8K377 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrtm1Q8K377 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrtm1Q8K377 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrtm1Q8K377 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm1Q8K377 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrtm1Q8K377 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrtm1Q8K377 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrtm1Q8K377 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrtm1Q8K377 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrtm1Q8K377 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm1Q8K377 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm1Q8K377 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrtm1Q8K377 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrtm1Q8K377 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrtm1Q8K377 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrtm1Q8K377 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm1Q8K377 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrtm1Q8K377 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrtm1Q8K377 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrtm1Q8K377 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrtm1Q8K377 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrtm1Q8K377 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrtm1Q8K377 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrtm1Q8K377 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrtm1Q8K377 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm1Q8K377 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrtm1Q8K377 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrtm1Q8K377 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrtm1Q8K377 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrtm1Q8K377 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrtm1Q8K377 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrtm1Q8K377 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrtm1Q8K377 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms