Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf13Q8K2W6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf13Q8K2W6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf13Q8K2W6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf13Q8K2W6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf13Q8K2W6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf13Q8K2W6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf13Q8K2W6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf13Q8K2W6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf13Q8K2W6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf13Q8K2W6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf13Q8K2W6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf13Q8K2W6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf13Q8K2W6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf13Q8K2W6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf13Q8K2W6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf13Q8K2W6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf13Q8K2W6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf13Q8K2W6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf13Q8K2W6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf13Q8K2W6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf13Q8K2W6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf13Q8K2W6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf13Q8K2W6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf13Q8K2W6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf13Q8K2W6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf13Q8K2W6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf13Q8K2W6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf13Q8K2W6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf13Q8K2W6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf13Q8K2W6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phf13Q8K2W6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf13Q8K2W6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf13Q8K2W6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf13Q8K2W6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf13Q8K2W6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf13Q8K2W6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Phf13Q8K2W6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phf13Q8K2W6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phf13Q8K2W6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phf13Q8K2W6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phf13Q8K2W6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phf13Q8K2W6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phf13Q8K2W6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Phf13Q8K2W6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf13Q8K2W6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phf13Q8K2W6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phf13Q8K2W6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf13Q8K2W6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phf13Q8K2W6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf13Q8K2W6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf13Q8K2W6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phf13Q8K2W6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Phf13Q8K2W6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phf13Q8K2W6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf13Q8K2W6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phf13Q8K2W6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf13Q8K2W6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phf13Q8K2W6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phf13Q8K2W6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phf13Q8K2W6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phf13Q8K2W6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf13Q8K2W6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf13Q8K2W6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phf13Q8K2W6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Phf13Q8K2W6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf13Q8K2W6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phf13Q8K2W6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phf13Q8K2W6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phf13Q8K2W6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phf13Q8K2W6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Phf13Q8K2W6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Phf13Q8K2W6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf13Q8K2W6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phf13Q8K2W6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phf13Q8K2W6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phf13Q8K2W6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Phf13Q8K2W6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Phf13Q8K2W6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf13Q8K2W6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Phf13Q8K2W6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Phf13Q8K2W6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf13Q8K2W6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf13Q8K2W6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Phf13Q8K2W6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf13Q8K2W6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf13Q8K2W6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Phf13Q8K2W6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf13Q8K2W6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms