Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Brd3Q8K2F0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Brd3Q8K2F0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Brd3Q8K2F0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Brd3Q8K2F0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Brd3Q8K2F0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Brd3Q8K2F0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Brd3Q8K2F0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Brd3Q8K2F0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Brd3Q8K2F0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Brd3Q8K2F0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Brd3Q8K2F0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Brd3Q8K2F0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Brd3Q8K2F0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Brd3Q8K2F0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Brd3Q8K2F0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Brd3Q8K2F0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Brd3Q8K2F0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Brd3Q8K2F0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Brd3Q8K2F0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Brd3Q8K2F0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Brd3Q8K2F0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brd3Q8K2F0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Brd3Q8K2F0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Brd3Q8K2F0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Brd3Q8K2F0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Brd3Q8K2F0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Brd3Q8K2F0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Brd3Q8K2F0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Brd3Q8K2F0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Brd3Q8K2F0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Brd3Q8K2F0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Brd3Q8K2F0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Brd3Q8K2F0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Brd3Q8K2F0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Brd3Q8K2F0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Brd3Q8K2F0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Brd3Q8K2F0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Brd3Q8K2F0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Brd3Q8K2F0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Brd3Q8K2F0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Brd3Q8K2F0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Brd3Q8K2F0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Brd3Q8K2F0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Brd3Q8K2F0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Brd3Q8K2F0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Brd3Q8K2F0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Brd3Q8K2F0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Brd3Q8K2F0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Brd3Q8K2F0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Brd3Q8K2F0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Brd3Q8K2F0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Brd3Q8K2F0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brd3Q8K2F0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Brd3Q8K2F0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Brd3Q8K2F0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Brd3Q8K2F0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brd3Q8K2F0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brd3Q8K2F0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brd3Q8K2F0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brd3Q8K2F0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brd3Q8K2F0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brd3Q8K2F0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brd3Q8K2F0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brd3Q8K2F0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brd3Q8K2F0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brd3Q8K2F0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brd3Q8K2F0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brd3Q8K2F0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Brd3Q8K2F0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brd3Q8K2F0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brd3Q8K2F0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brd3Q8K2F0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brd3Q8K2F0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brd3Q8K2F0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brd3Q8K2F0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brd3Q8K2F0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brd3Q8K2F0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brd3Q8K2F0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Brd3Q8K2F0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brd3Q8K2F0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Brd3Q8K2F0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Brd3Q8K2F0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brd3Q8K2F0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brd3Q8K2F0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brd3Q8K2F0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brd3Q8K2F0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Brd3Q8K2F0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Brd3Q8K2F0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Brd3Q8K2F0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms