Protein–RNA interactions for Protein: Q8K262

Plac9, Placenta-specific protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac9Q8K262 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plac9Q8K262 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plac9Q8K262 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plac9Q8K262 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Plac9Q8K262 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Plac9Q8K262 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Plac9Q8K262 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Plac9Q8K262 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Plac9Q8K262 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Plac9Q8K262 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Plac9Q8K262 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Plac9Q8K262 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plac9Q8K262 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Plac9Q8K262 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Plac9Q8K262 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Plac9Q8K262 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Plac9Q8K262 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Plac9Q8K262 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Plac9Q8K262 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Plac9Q8K262 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plac9Q8K262 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plac9Q8K262 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plac9Q8K262 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plac9Q8K262 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plac9Q8K262 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plac9Q8K262 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plac9Q8K262 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Plac9Q8K262 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plac9Q8K262 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plac9Q8K262 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Plac9Q8K262 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Plac9Q8K262 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Plac9Q8K262 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plac9Q8K262 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Plac9Q8K262 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plac9Q8K262 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plac9Q8K262 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Plac9Q8K262 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Plac9Q8K262 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plac9Q8K262 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Plac9Q8K262 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Plac9Q8K262 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Plac9Q8K262 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Plac9Q8K262 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Plac9Q8K262 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Plac9Q8K262 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plac9Q8K262 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Plac9Q8K262 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Plac9Q8K262 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Plac9Q8K262 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Plac9Q8K262 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Plac9Q8K262 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Plac9Q8K262 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plac9Q8K262 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Plac9Q8K262 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plac9Q8K262 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Plac9Q8K262 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plac9Q8K262 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plac9Q8K262 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plac9Q8K262 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Plac9Q8K262 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plac9Q8K262 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plac9Q8K262 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plac9Q8K262 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plac9Q8K262 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plac9Q8K262 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plac9Q8K262 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plac9Q8K262 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Plac9Q8K262 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Plac9Q8K262 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plac9Q8K262 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plac9Q8K262 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plac9Q8K262 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plac9Q8K262 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plac9Q8K262 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plac9Q8K262 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plac9Q8K262 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plac9Q8K262 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plac9Q8K262 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Plac9Q8K262 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plac9Q8K262 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plac9Q8K262 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plac9Q8K262 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plac9Q8K262 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Plac9Q8K262 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plac9Q8K262 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plac9Q8K262 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plac9Q8K262 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238 ms