Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem17Q8K0U3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem17Q8K0U3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem17Q8K0U3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem17Q8K0U3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem17Q8K0U3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem17Q8K0U3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem17Q8K0U3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem17Q8K0U3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem17Q8K0U3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem17Q8K0U3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem17Q8K0U3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem17Q8K0U3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem17Q8K0U3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem17Q8K0U3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem17Q8K0U3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem17Q8K0U3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem17Q8K0U3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem17Q8K0U3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem17Q8K0U3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem17Q8K0U3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem17Q8K0U3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem17Q8K0U3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem17Q8K0U3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem17Q8K0U3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem17Q8K0U3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem17Q8K0U3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem17Q8K0U3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem17Q8K0U3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem17Q8K0U3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem17Q8K0U3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem17Q8K0U3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem17Q8K0U3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem17Q8K0U3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem17Q8K0U3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem17Q8K0U3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem17Q8K0U3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem17Q8K0U3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem17Q8K0U3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem17Q8K0U3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem17Q8K0U3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem17Q8K0U3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem17Q8K0U3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem17Q8K0U3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem17Q8K0U3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem17Q8K0U3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem17Q8K0U3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem17Q8K0U3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem17Q8K0U3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem17Q8K0U3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem17Q8K0U3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem17Q8K0U3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem17Q8K0U3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem17Q8K0U3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem17Q8K0U3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem17Q8K0U3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem17Q8K0U3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem17Q8K0U3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem17Q8K0U3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem17Q8K0U3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem17Q8K0U3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem17Q8K0U3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem17Q8K0U3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem17Q8K0U3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem17Q8K0U3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem17Q8K0U3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem17Q8K0U3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem17Q8K0U3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem17Q8K0U3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem17Q8K0U3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem17Q8K0U3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem17Q8K0U3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem17Q8K0U3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem17Q8K0U3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem17Q8K0U3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem17Q8K0U3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem17Q8K0U3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem17Q8K0U3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem17Q8K0U3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem17Q8K0U3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem17Q8K0U3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem17Q8K0U3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem17Q8K0U3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem17Q8K0U3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem17Q8K0U3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem17Q8K0U3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem17Q8K0U3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem17Q8K0U3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem17Q8K0U3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem17Q8K0U3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem17Q8K0U3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem17Q8K0U3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem17Q8K0U3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem17Q8K0U3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem17Q8K0U3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem17Q8K0U3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem17Q8K0U3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem17Q8K0U3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem17Q8K0U3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem17Q8K0U3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms