Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cpne5Q8JZW4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpne5Q8JZW4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cpne5Q8JZW4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpne5Q8JZW4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cpne5Q8JZW4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpne5Q8JZW4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpne5Q8JZW4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cpne5Q8JZW4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cpne5Q8JZW4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpne5Q8JZW4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cpne5Q8JZW4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cpne5Q8JZW4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpne5Q8JZW4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpne5Q8JZW4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpne5Q8JZW4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cpne5Q8JZW4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cpne5Q8JZW4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cpne5Q8JZW4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cpne5Q8JZW4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpne5Q8JZW4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cpne5Q8JZW4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpne5Q8JZW4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cpne5Q8JZW4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpne5Q8JZW4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpne5Q8JZW4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cpne5Q8JZW4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpne5Q8JZW4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpne5Q8JZW4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpne5Q8JZW4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpne5Q8JZW4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpne5Q8JZW4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpne5Q8JZW4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cpne5Q8JZW4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cpne5Q8JZW4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cpne5Q8JZW4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cpne5Q8JZW4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpne5Q8JZW4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpne5Q8JZW4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpne5Q8JZW4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpne5Q8JZW4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpne5Q8JZW4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpne5Q8JZW4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpne5Q8JZW4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpne5Q8JZW4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpne5Q8JZW4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpne5Q8JZW4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpne5Q8JZW4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpne5Q8JZW4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpne5Q8JZW4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne5Q8JZW4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpne5Q8JZW4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpne5Q8JZW4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpne5Q8JZW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpne5Q8JZW4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpne5Q8JZW4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne5Q8JZW4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpne5Q8JZW4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpne5Q8JZW4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpne5Q8JZW4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpne5Q8JZW4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpne5Q8JZW4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpne5Q8JZW4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cpne5Q8JZW4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpne5Q8JZW4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpne5Q8JZW4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpne5Q8JZW4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpne5Q8JZW4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpne5Q8JZW4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpne5Q8JZW4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpne5Q8JZW4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpne5Q8JZW4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne5Q8JZW4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpne5Q8JZW4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpne5Q8JZW4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cpne5Q8JZW4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpne5Q8JZW4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne5Q8JZW4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpne5Q8JZW4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpne5Q8JZW4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne5Q8JZW4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpne5Q8JZW4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpne5Q8JZW4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne5Q8JZW4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpne5Q8JZW4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne5Q8JZW4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne5Q8JZW4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpne5Q8JZW4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cpne5Q8JZW4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne5Q8JZW4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpne5Q8JZW4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpne5Q8JZW4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpne5Q8JZW4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpne5Q8JZW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne5Q8JZW4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpne5Q8JZW4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne5Q8JZW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne5Q8JZW4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpne5Q8JZW4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms