Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nupl2Q8CIC2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nupl2Q8CIC2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nupl2Q8CIC2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nupl2Q8CIC2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nupl2Q8CIC2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nupl2Q8CIC2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nupl2Q8CIC2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nupl2Q8CIC2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nupl2Q8CIC2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nupl2Q8CIC2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nupl2Q8CIC2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nupl2Q8CIC2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nupl2Q8CIC2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nupl2Q8CIC2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nupl2Q8CIC2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nupl2Q8CIC2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nupl2Q8CIC2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nupl2Q8CIC2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nupl2Q8CIC2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nupl2Q8CIC2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nupl2Q8CIC2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nupl2Q8CIC2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nupl2Q8CIC2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nupl2Q8CIC2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nupl2Q8CIC2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nupl2Q8CIC2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nupl2Q8CIC2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nupl2Q8CIC2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nupl2Q8CIC2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nupl2Q8CIC2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nupl2Q8CIC2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nupl2Q8CIC2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nupl2Q8CIC2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nupl2Q8CIC2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nupl2Q8CIC2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nupl2Q8CIC2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nupl2Q8CIC2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nupl2Q8CIC2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nupl2Q8CIC2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nupl2Q8CIC2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nupl2Q8CIC2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nupl2Q8CIC2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nupl2Q8CIC2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nupl2Q8CIC2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nupl2Q8CIC2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nupl2Q8CIC2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nupl2Q8CIC2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nupl2Q8CIC2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nupl2Q8CIC2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nupl2Q8CIC2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nupl2Q8CIC2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nupl2Q8CIC2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nupl2Q8CIC2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nupl2Q8CIC2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nupl2Q8CIC2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nupl2Q8CIC2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nupl2Q8CIC2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nupl2Q8CIC2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nupl2Q8CIC2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nupl2Q8CIC2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nupl2Q8CIC2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nupl2Q8CIC2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nupl2Q8CIC2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nupl2Q8CIC2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nupl2Q8CIC2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nupl2Q8CIC2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nupl2Q8CIC2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nupl2Q8CIC2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nupl2Q8CIC2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nupl2Q8CIC2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nupl2Q8CIC2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nupl2Q8CIC2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nupl2Q8CIC2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nupl2Q8CIC2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nupl2Q8CIC2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nupl2Q8CIC2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nupl2Q8CIC2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nupl2Q8CIC2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms