Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp11Q8CFF0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp11Q8CFF0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp11Q8CFF0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp11Q8CFF0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp11Q8CFF0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp11Q8CFF0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Parp11Q8CFF0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Parp11Q8CFF0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Parp11Q8CFF0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Parp11Q8CFF0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Parp11Q8CFF0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Parp11Q8CFF0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Parp11Q8CFF0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Parp11Q8CFF0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Parp11Q8CFF0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Parp11Q8CFF0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Parp11Q8CFF0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp11Q8CFF0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp11Q8CFF0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Parp11Q8CFF0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Parp11Q8CFF0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Parp11Q8CFF0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp11Q8CFF0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Parp11Q8CFF0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Parp11Q8CFF0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Parp11Q8CFF0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Parp11Q8CFF0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Parp11Q8CFF0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Parp11Q8CFF0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Parp11Q8CFF0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Parp11Q8CFF0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Parp11Q8CFF0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp11Q8CFF0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp11Q8CFF0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp11Q8CFF0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp11Q8CFF0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp11Q8CFF0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp11Q8CFF0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp11Q8CFF0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp11Q8CFF0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp11Q8CFF0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp11Q8CFF0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp11Q8CFF0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp11Q8CFF0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp11Q8CFF0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp11Q8CFF0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp11Q8CFF0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp11Q8CFF0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Parp11Q8CFF0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp11Q8CFF0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Parp11Q8CFF0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp11Q8CFF0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp11Q8CFF0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Parp11Q8CFF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Parp11Q8CFF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp11Q8CFF0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Parp11Q8CFF0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp11Q8CFF0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Parp11Q8CFF0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Parp11Q8CFF0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Parp11Q8CFF0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Parp11Q8CFF0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Parp11Q8CFF0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Parp11Q8CFF0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Parp11Q8CFF0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Parp11Q8CFF0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Parp11Q8CFF0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Parp11Q8CFF0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Parp11Q8CFF0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp11Q8CFF0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Parp11Q8CFF0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp11Q8CFF0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp11Q8CFF0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp11Q8CFF0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp11Q8CFF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp11Q8CFF0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp11Q8CFF0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Parp11Q8CFF0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Parp11Q8CFF0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Parp11Q8CFF0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Parp11Q8CFF0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Parp11Q8CFF0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Parp11Q8CFF0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Parp11Q8CFF0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp11Q8CFF0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp11Q8CFF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp11Q8CFF0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Parp11Q8CFF0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Parp11Q8CFF0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Parp11Q8CFF0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Parp11Q8CFF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Parp11Q8CFF0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Parp11Q8CFF0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Parp11Q8CFF0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Parp11Q8CFF0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Parp11Q8CFF0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Parp11Q8CFF0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Parp11Q8CFF0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Parp11Q8CFF0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms