Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X8

Lmf2, Lipase maturation factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf2Q8C3X8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmf2Q8C3X8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmf2Q8C3X8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmf2Q8C3X8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmf2Q8C3X8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmf2Q8C3X8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmf2Q8C3X8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmf2Q8C3X8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmf2Q8C3X8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmf2Q8C3X8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmf2Q8C3X8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmf2Q8C3X8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmf2Q8C3X8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmf2Q8C3X8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmf2Q8C3X8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmf2Q8C3X8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmf2Q8C3X8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmf2Q8C3X8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmf2Q8C3X8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmf2Q8C3X8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmf2Q8C3X8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmf2Q8C3X8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmf2Q8C3X8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmf2Q8C3X8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmf2Q8C3X8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmf2Q8C3X8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmf2Q8C3X8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmf2Q8C3X8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmf2Q8C3X8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmf2Q8C3X8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmf2Q8C3X8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmf2Q8C3X8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmf2Q8C3X8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmf2Q8C3X8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmf2Q8C3X8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmf2Q8C3X8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmf2Q8C3X8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmf2Q8C3X8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmf2Q8C3X8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmf2Q8C3X8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmf2Q8C3X8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmf2Q8C3X8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmf2Q8C3X8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmf2Q8C3X8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lmf2Q8C3X8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lmf2Q8C3X8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmf2Q8C3X8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmf2Q8C3X8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmf2Q8C3X8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmf2Q8C3X8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmf2Q8C3X8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmf2Q8C3X8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmf2Q8C3X8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmf2Q8C3X8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmf2Q8C3X8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmf2Q8C3X8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmf2Q8C3X8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf2Q8C3X8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmf2Q8C3X8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmf2Q8C3X8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmf2Q8C3X8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmf2Q8C3X8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmf2Q8C3X8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmf2Q8C3X8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmf2Q8C3X8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmf2Q8C3X8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmf2Q8C3X8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lmf2Q8C3X8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lmf2Q8C3X8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmf2Q8C3X8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmf2Q8C3X8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lmf2Q8C3X8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lmf2Q8C3X8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lmf2Q8C3X8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lmf2Q8C3X8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmf2Q8C3X8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lmf2Q8C3X8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lmf2Q8C3X8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Lmf2Q8C3X8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf2Q8C3X8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf2Q8C3X8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf2Q8C3X8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lmf2Q8C3X8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmf2Q8C3X8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmf2Q8C3X8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmf2Q8C3X8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lmf2Q8C3X8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lmf2Q8C3X8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lmf2Q8C3X8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lmf2Q8C3X8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms