Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdac7Q8C2B3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hdac7Q8C2B3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hdac7Q8C2B3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hdac7Q8C2B3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac7Q8C2B3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hdac7Q8C2B3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac7Q8C2B3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdac7Q8C2B3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac7Q8C2B3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdac7Q8C2B3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Hdac7Q8C2B3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hdac7Q8C2B3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac7Q8C2B3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hdac7Q8C2B3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdac7Q8C2B3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hdac7Q8C2B3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac7Q8C2B3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hdac7Q8C2B3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdac7Q8C2B3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac7Q8C2B3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hdac7Q8C2B3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hdac7Q8C2B3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac7Q8C2B3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac7Q8C2B3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac7Q8C2B3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac7Q8C2B3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac7Q8C2B3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac7Q8C2B3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac7Q8C2B3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac7Q8C2B3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac7Q8C2B3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac7Q8C2B3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdac7Q8C2B3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Hdac7Q8C2B3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hdac7Q8C2B3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac7Q8C2B3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hdac7Q8C2B3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hdac7Q8C2B3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac7Q8C2B3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hdac7Q8C2B3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hdac7Q8C2B3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hdac7Q8C2B3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hdac7Q8C2B3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac7Q8C2B3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Hdac7Q8C2B3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hdac7Q8C2B3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hdac7Q8C2B3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac7Q8C2B3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hdac7Q8C2B3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hdac7Q8C2B3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Hdac7Q8C2B3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hdac7Q8C2B3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hdac7Q8C2B3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac7Q8C2B3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hdac7Q8C2B3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hdac7Q8C2B3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac7Q8C2B3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Hdac7Q8C2B3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hdac7Q8C2B3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac7Q8C2B3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac7Q8C2B3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hdac7Q8C2B3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac7Q8C2B3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac7Q8C2B3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac7Q8C2B3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac7Q8C2B3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac7Q8C2B3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Hdac7Q8C2B3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac7Q8C2B3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac7Q8C2B3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac7Q8C2B3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac7Q8C2B3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac7Q8C2B3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac7Q8C2B3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac7Q8C2B3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac7Q8C2B3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac7Q8C2B3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac7Q8C2B3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac7Q8C2B3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac7Q8C2B3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac7Q8C2B3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac7Q8C2B3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac7Q8C2B3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac7Q8C2B3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac7Q8C2B3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac7Q8C2B3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac7Q8C2B3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac7Q8C2B3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac7Q8C2B3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac7Q8C2B3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac7Q8C2B3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hdac7Q8C2B3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hdac7Q8C2B3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac7Q8C2B3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hdac7Q8C2B3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hdac7Q8C2B3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hdac7Q8C2B3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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