Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tnfsfm13Q8BXS2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfsfm13Q8BXS2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsfm13Q8BXS2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsfm13Q8BXS2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsfm13Q8BXS2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnfsfm13Q8BXS2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsfm13Q8BXS2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsfm13Q8BXS2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfsfm13Q8BXS2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnfsfm13Q8BXS2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfsfm13Q8BXS2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsfm13Q8BXS2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfsfm13Q8BXS2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsfm13Q8BXS2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsfm13Q8BXS2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfsfm13Q8BXS2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsfm13Q8BXS2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsfm13Q8BXS2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsfm13Q8BXS2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsfm13Q8BXS2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsfm13Q8BXS2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tnfsfm13Q8BXS2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfsfm13Q8BXS2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnfsfm13Q8BXS2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfsfm13Q8BXS2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfsfm13Q8BXS2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsfm13Q8BXS2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsfm13Q8BXS2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfsfm13Q8BXS2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsfm13Q8BXS2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsfm13Q8BXS2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsfm13Q8BXS2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsfm13Q8BXS2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsfm13Q8BXS2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsfm13Q8BXS2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsfm13Q8BXS2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsfm13Q8BXS2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms