Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arfrp1Q8BXL7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arfrp1Q8BXL7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arfrp1Q8BXL7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfrp1Q8BXL7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfrp1Q8BXL7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfrp1Q8BXL7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfrp1Q8BXL7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arfrp1Q8BXL7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfrp1Q8BXL7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfrp1Q8BXL7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfrp1Q8BXL7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfrp1Q8BXL7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfrp1Q8BXL7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfrp1Q8BXL7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfrp1Q8BXL7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfrp1Q8BXL7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfrp1Q8BXL7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfrp1Q8BXL7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfrp1Q8BXL7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfrp1Q8BXL7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfrp1Q8BXL7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfrp1Q8BXL7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfrp1Q8BXL7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfrp1Q8BXL7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfrp1Q8BXL7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfrp1Q8BXL7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfrp1Q8BXL7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfrp1Q8BXL7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfrp1Q8BXL7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfrp1Q8BXL7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfrp1Q8BXL7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfrp1Q8BXL7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfrp1Q8BXL7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfrp1Q8BXL7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfrp1Q8BXL7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arfrp1Q8BXL7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfrp1Q8BXL7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfrp1Q8BXL7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arfrp1Q8BXL7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Arfrp1Q8BXL7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfrp1Q8BXL7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arfrp1Q8BXL7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfrp1Q8BXL7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arfrp1Q8BXL7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arfrp1Q8BXL7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arfrp1Q8BXL7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfrp1Q8BXL7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arfrp1Q8BXL7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arfrp1Q8BXL7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arfrp1Q8BXL7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfrp1Q8BXL7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfrp1Q8BXL7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arfrp1Q8BXL7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Arfrp1Q8BXL7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfrp1Q8BXL7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arfrp1Q8BXL7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arfrp1Q8BXL7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Arfrp1Q8BXL7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfrp1Q8BXL7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfrp1Q8BXL7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfrp1Q8BXL7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arfrp1Q8BXL7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfrp1Q8BXL7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfrp1Q8BXL7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfrp1Q8BXL7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arfrp1Q8BXL7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arfrp1Q8BXL7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arfrp1Q8BXL7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arfrp1Q8BXL7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arfrp1Q8BXL7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arfrp1Q8BXL7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arfrp1Q8BXL7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arfrp1Q8BXL7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfrp1Q8BXL7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfrp1Q8BXL7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfrp1Q8BXL7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arfrp1Q8BXL7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arfrp1Q8BXL7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arfrp1Q8BXL7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arfrp1Q8BXL7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arfrp1Q8BXL7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arfrp1Q8BXL7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arfrp1Q8BXL7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arfrp1Q8BXL7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfrp1Q8BXL7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfrp1Q8BXL7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arfrp1Q8BXL7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Arfrp1Q8BXL7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Arfrp1Q8BXL7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfrp1Q8BXL7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfrp1Q8BXL7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfrp1Q8BXL7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arfrp1Q8BXL7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms