Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ckap4Q8BMK4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ckap4Q8BMK4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ckap4Q8BMK4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ckap4Q8BMK4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ckap4Q8BMK4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ckap4Q8BMK4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ckap4Q8BMK4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ckap4Q8BMK4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ckap4Q8BMK4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap4Q8BMK4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap4Q8BMK4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ckap4Q8BMK4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ckap4Q8BMK4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ckap4Q8BMK4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap4Q8BMK4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ckap4Q8BMK4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ckap4Q8BMK4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ckap4Q8BMK4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ckap4Q8BMK4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ckap4Q8BMK4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ckap4Q8BMK4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap4Q8BMK4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ckap4Q8BMK4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ckap4Q8BMK4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ckap4Q8BMK4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ckap4Q8BMK4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ckap4Q8BMK4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ckap4Q8BMK4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ckap4Q8BMK4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ckap4Q8BMK4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ckap4Q8BMK4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ckap4Q8BMK4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ckap4Q8BMK4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ckap4Q8BMK4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ckap4Q8BMK4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ckap4Q8BMK4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ckap4Q8BMK4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ckap4Q8BMK4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ckap4Q8BMK4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ckap4Q8BMK4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ckap4Q8BMK4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ckap4Q8BMK4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ckap4Q8BMK4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap4Q8BMK4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ckap4Q8BMK4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ckap4Q8BMK4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ckap4Q8BMK4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ckap4Q8BMK4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ckap4Q8BMK4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ckap4Q8BMK4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap4Q8BMK4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ckap4Q8BMK4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap4Q8BMK4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ckap4Q8BMK4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ckap4Q8BMK4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ckap4Q8BMK4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ckap4Q8BMK4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ckap4Q8BMK4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap4Q8BMK4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ckap4Q8BMK4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ckap4Q8BMK4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ckap4Q8BMK4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ckap4Q8BMK4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ckap4Q8BMK4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ckap4Q8BMK4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ckap4Q8BMK4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ckap4Q8BMK4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ckap4Q8BMK4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ckap4Q8BMK4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ckap4Q8BMK4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ckap4Q8BMK4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ckap4Q8BMK4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap4Q8BMK4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ckap4Q8BMK4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ckap4Q8BMK4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckap4Q8BMK4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckap4Q8BMK4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap4Q8BMK4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap4Q8BMK4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap4Q8BMK4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ckap4Q8BMK4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckap4Q8BMK4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckap4Q8BMK4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap4Q8BMK4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap4Q8BMK4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap4Q8BMK4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap4Q8BMK4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap4Q8BMK4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap4Q8BMK4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap4Q8BMK4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap4Q8BMK4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap4Q8BMK4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap4Q8BMK4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap4Q8BMK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap4Q8BMK4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap4Q8BMK4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap4Q8BMK4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap4Q8BMK4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ckap4Q8BMK4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms