Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmd3Q8BHD4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Frmd3Q8BHD4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Frmd3Q8BHD4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Frmd3Q8BHD4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmd3Q8BHD4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Frmd3Q8BHD4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Frmd3Q8BHD4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Frmd3Q8BHD4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmd3Q8BHD4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Frmd3Q8BHD4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmd3Q8BHD4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmd3Q8BHD4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Frmd3Q8BHD4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Frmd3Q8BHD4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frmd3Q8BHD4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Frmd3Q8BHD4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmd3Q8BHD4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmd3Q8BHD4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmd3Q8BHD4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Frmd3Q8BHD4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmd3Q8BHD4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Frmd3Q8BHD4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmd3Q8BHD4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Frmd3Q8BHD4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Frmd3Q8BHD4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmd3Q8BHD4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Frmd3Q8BHD4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Frmd3Q8BHD4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Frmd3Q8BHD4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Frmd3Q8BHD4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Frmd3Q8BHD4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Frmd3Q8BHD4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Frmd3Q8BHD4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Frmd3Q8BHD4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Frmd3Q8BHD4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Frmd3Q8BHD4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmd3Q8BHD4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Frmd3Q8BHD4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Frmd3Q8BHD4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Frmd3Q8BHD4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Frmd3Q8BHD4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Frmd3Q8BHD4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Frmd3Q8BHD4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Frmd3Q8BHD4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Frmd3Q8BHD4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmd3Q8BHD4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Frmd3Q8BHD4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Frmd3Q8BHD4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Frmd3Q8BHD4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Frmd3Q8BHD4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Frmd3Q8BHD4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Frmd3Q8BHD4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Frmd3Q8BHD4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmd3Q8BHD4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmd3Q8BHD4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmd3Q8BHD4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmd3Q8BHD4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmd3Q8BHD4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmd3Q8BHD4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmd3Q8BHD4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmd3Q8BHD4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmd3Q8BHD4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmd3Q8BHD4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmd3Q8BHD4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmd3Q8BHD4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmd3Q8BHD4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmd3Q8BHD4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Frmd3Q8BHD4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Frmd3Q8BHD4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmd3Q8BHD4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Frmd3Q8BHD4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Frmd3Q8BHD4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frmd3Q8BHD4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmd3Q8BHD4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmd3Q8BHD4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmd3Q8BHD4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frmd3Q8BHD4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Frmd3Q8BHD4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Frmd3Q8BHD4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmd3Q8BHD4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmd3Q8BHD4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frmd3Q8BHD4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmd3Q8BHD4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmd3Q8BHD4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmd3Q8BHD4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frmd3Q8BHD4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Frmd3Q8BHD4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmd3Q8BHD4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Frmd3Q8BHD4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Frmd3Q8BHD4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmd3Q8BHD4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frmd3Q8BHD4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frmd3Q8BHD4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmd3Q8BHD4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmd3Q8BHD4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Frmd3Q8BHD4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Frmd3Q8BHD4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmd3Q8BHD4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Frmd3Q8BHD4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms