Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Vipas39Q8BGQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Vipas39Q8BGQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Vipas39Q8BGQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Vipas39Q8BGQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Vipas39Q8BGQ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vipas39Q8BGQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Vipas39Q8BGQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vipas39Q8BGQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Vipas39Q8BGQ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Vipas39Q8BGQ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Vipas39Q8BGQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vipas39Q8BGQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vipas39Q8BGQ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Vipas39Q8BGQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Vipas39Q8BGQ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Vipas39Q8BGQ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vipas39Q8BGQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Vipas39Q8BGQ1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vipas39Q8BGQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vipas39Q8BGQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Vipas39Q8BGQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vipas39Q8BGQ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vipas39Q8BGQ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vipas39Q8BGQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vipas39Q8BGQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vipas39Q8BGQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vipas39Q8BGQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vipas39Q8BGQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vipas39Q8BGQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vipas39Q8BGQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Vipas39Q8BGQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vipas39Q8BGQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vipas39Q8BGQ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vipas39Q8BGQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vipas39Q8BGQ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vipas39Q8BGQ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vipas39Q8BGQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vipas39Q8BGQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vipas39Q8BGQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Vipas39Q8BGQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vipas39Q8BGQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vipas39Q8BGQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Vipas39Q8BGQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vipas39Q8BGQ1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vipas39Q8BGQ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vipas39Q8BGQ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Vipas39Q8BGQ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vipas39Q8BGQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Vipas39Q8BGQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vipas39Q8BGQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vipas39Q8BGQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vipas39Q8BGQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vipas39Q8BGQ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Vipas39Q8BGQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vipas39Q8BGQ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Vipas39Q8BGQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vipas39Q8BGQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vipas39Q8BGQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vipas39Q8BGQ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vipas39Q8BGQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Vipas39Q8BGQ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Vipas39Q8BGQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vipas39Q8BGQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vipas39Q8BGQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vipas39Q8BGQ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vipas39Q8BGQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vipas39Q8BGQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vipas39Q8BGQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vipas39Q8BGQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vipas39Q8BGQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Vipas39Q8BGQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vipas39Q8BGQ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vipas39Q8BGQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vipas39Q8BGQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vipas39Q8BGQ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Vipas39Q8BGQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vipas39Q8BGQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vipas39Q8BGQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vipas39Q8BGQ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vipas39Q8BGQ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vipas39Q8BGQ1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vipas39Q8BGQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vipas39Q8BGQ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vipas39Q8BGQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
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