Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ChfrQ810L3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ChfrQ810L3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ChfrQ810L3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ChfrQ810L3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ChfrQ810L3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ChfrQ810L3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ChfrQ810L3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ChfrQ810L3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ChfrQ810L3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ChfrQ810L3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ChfrQ810L3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ChfrQ810L3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ChfrQ810L3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ChfrQ810L3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ChfrQ810L3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ChfrQ810L3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ChfrQ810L3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ChfrQ810L3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ChfrQ810L3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ChfrQ810L3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ChfrQ810L3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ChfrQ810L3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ChfrQ810L3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ChfrQ810L3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ChfrQ810L3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ChfrQ810L3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ChfrQ810L3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ChfrQ810L3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ChfrQ810L3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ChfrQ810L3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChfrQ810L3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChfrQ810L3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ChfrQ810L3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ChfrQ810L3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ChfrQ810L3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ChfrQ810L3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ChfrQ810L3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ChfrQ810L3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ChfrQ810L3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ChfrQ810L3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ChfrQ810L3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChfrQ810L3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ChfrQ810L3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ChfrQ810L3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ChfrQ810L3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChfrQ810L3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ChfrQ810L3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChfrQ810L3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ChfrQ810L3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ChfrQ810L3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ChfrQ810L3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ChfrQ810L3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ChfrQ810L3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ChfrQ810L3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ChfrQ810L3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ChfrQ810L3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ChfrQ810L3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChfrQ810L3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ChfrQ810L3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ChfrQ810L3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ChfrQ810L3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ChfrQ810L3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ChfrQ810L3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ChfrQ810L3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ChfrQ810L3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ChfrQ810L3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ChfrQ810L3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ChfrQ810L3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ChfrQ810L3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ChfrQ810L3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ChfrQ810L3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ChfrQ810L3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ChfrQ810L3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ChfrQ810L3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChfrQ810L3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ChfrQ810L3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChfrQ810L3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ChfrQ810L3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ChfrQ810L3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ChfrQ810L3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ChfrQ810L3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChfrQ810L3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ChfrQ810L3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChfrQ810L3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ChfrQ810L3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ChfrQ810L3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChfrQ810L3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ChfrQ810L3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ChfrQ810L3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ChfrQ810L3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ChfrQ810L3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChfrQ810L3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ChfrQ810L3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ChfrQ810L3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChfrQ810L3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ChfrQ810L3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ChfrQ810L3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ChfrQ810L3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ChfrQ810L3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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