Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD8

Prap1, Proline-rich acidic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prap1Q80XD8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prap1Q80XD8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prap1Q80XD8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prap1Q80XD8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prap1Q80XD8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prap1Q80XD8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prap1Q80XD8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prap1Q80XD8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Prap1Q80XD8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prap1Q80XD8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prap1Q80XD8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prap1Q80XD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prap1Q80XD8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prap1Q80XD8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prap1Q80XD8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prap1Q80XD8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prap1Q80XD8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prap1Q80XD8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prap1Q80XD8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prap1Q80XD8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prap1Q80XD8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prap1Q80XD8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prap1Q80XD8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prap1Q80XD8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prap1Q80XD8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prap1Q80XD8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prap1Q80XD8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prap1Q80XD8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prap1Q80XD8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prap1Q80XD8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prap1Q80XD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prap1Q80XD8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prap1Q80XD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prap1Q80XD8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prap1Q80XD8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prap1Q80XD8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prap1Q80XD8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prap1Q80XD8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prap1Q80XD8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prap1Q80XD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prap1Q80XD8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prap1Q80XD8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prap1Q80XD8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prap1Q80XD8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prap1Q80XD8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prap1Q80XD8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prap1Q80XD8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prap1Q80XD8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prap1Q80XD8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prap1Q80XD8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prap1Q80XD8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prap1Q80XD8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prap1Q80XD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prap1Q80XD8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prap1Q80XD8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prap1Q80XD8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prap1Q80XD8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prap1Q80XD8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prap1Q80XD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prap1Q80XD8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prap1Q80XD8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prap1Q80XD8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prap1Q80XD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prap1Q80XD8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prap1Q80XD8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prap1Q80XD8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prap1Q80XD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prap1Q80XD8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prap1Q80XD8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prap1Q80XD8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prap1Q80XD8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prap1Q80XD8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prap1Q80XD8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prap1Q80XD8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prap1Q80XD8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prap1Q80XD8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prap1Q80XD8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prap1Q80XD8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prap1Q80XD8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prap1Q80XD8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prap1Q80XD8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prap1Q80XD8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prap1Q80XD8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prap1Q80XD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prap1Q80XD8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prap1Q80XD8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prap1Q80XD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prap1Q80XD8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prap1Q80XD8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prap1Q80XD8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prap1Q80XD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prap1Q80XD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prap1Q80XD8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prap1Q80XD8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prap1Q80XD8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prap1Q80XD8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prap1Q80XD8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prap1Q80XD8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prap1Q80XD8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prap1Q80XD8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms