Protein–RNA interactions for Protein: Q80W99

Catsper3, Cation channel sperm-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper3Q80W99 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Catsper3Q80W99 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Catsper3Q80W99 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Catsper3Q80W99 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Catsper3Q80W99 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Catsper3Q80W99 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Catsper3Q80W99 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Catsper3Q80W99 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Catsper3Q80W99 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Catsper3Q80W99 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Catsper3Q80W99 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Catsper3Q80W99 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Catsper3Q80W99 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Catsper3Q80W99 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Catsper3Q80W99 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Catsper3Q80W99 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Catsper3Q80W99 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Catsper3Q80W99 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Catsper3Q80W99 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Catsper3Q80W99 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Catsper3Q80W99 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Catsper3Q80W99 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Catsper3Q80W99 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Catsper3Q80W99 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Catsper3Q80W99 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Catsper3Q80W99 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Catsper3Q80W99 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Catsper3Q80W99 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Catsper3Q80W99 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Catsper3Q80W99 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Catsper3Q80W99 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Catsper3Q80W99 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Catsper3Q80W99 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Catsper3Q80W99 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Catsper3Q80W99 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Catsper3Q80W99 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Catsper3Q80W99 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Catsper3Q80W99 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Catsper3Q80W99 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Catsper3Q80W99 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Catsper3Q80W99 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Catsper3Q80W99 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Catsper3Q80W99 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Catsper3Q80W99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Catsper3Q80W99 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Catsper3Q80W99 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Catsper3Q80W99 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Catsper3Q80W99 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Catsper3Q80W99 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Catsper3Q80W99 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Catsper3Q80W99 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Catsper3Q80W99 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Catsper3Q80W99 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Catsper3Q80W99 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Catsper3Q80W99 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Catsper3Q80W99 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Catsper3Q80W99 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Catsper3Q80W99 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Catsper3Q80W99 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Catsper3Q80W99 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Catsper3Q80W99 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Catsper3Q80W99 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Catsper3Q80W99 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Catsper3Q80W99 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Catsper3Q80W99 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Catsper3Q80W99 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Catsper3Q80W99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Catsper3Q80W99 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Catsper3Q80W99 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Catsper3Q80W99 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Catsper3Q80W99 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Catsper3Q80W99 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Catsper3Q80W99 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Catsper3Q80W99 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Catsper3Q80W99 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Catsper3Q80W99 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Catsper3Q80W99 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Catsper3Q80W99 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Catsper3Q80W99 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Catsper3Q80W99 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Catsper3Q80W99 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Catsper3Q80W99 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Catsper3Q80W99 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Catsper3Q80W99 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Catsper3Q80W99 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Catsper3Q80W99 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Catsper3Q80W99 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Catsper3Q80W99 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Catsper3Q80W99 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Catsper3Q80W99 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms