Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Zfp397Q7TNK4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Zfp397Q7TNK4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Zfp397Q7TNK4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Zfp397Q7TNK4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Zfp397Q7TNK4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Zfp397Q7TNK4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Zfp397Q7TNK4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Zfp397Q7TNK4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Zfp397Q7TNK4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Zfp397Q7TNK4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Zfp397Q7TNK4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Zfp397Q7TNK4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zfp397Q7TNK4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zfp397Q7TNK4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zfp397Q7TNK4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zfp397Q7TNK4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zfp397Q7TNK4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zfp397Q7TNK4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zfp397Q7TNK4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zfp397Q7TNK4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zfp397Q7TNK4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Zfp397Q7TNK4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zfp397Q7TNK4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zfp397Q7TNK4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zfp397Q7TNK4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zfp397Q7TNK4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zfp397Q7TNK4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Zfp397Q7TNK4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Zfp397Q7TNK4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zfp397Q7TNK4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Zfp397Q7TNK4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zfp397Q7TNK4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zfp397Q7TNK4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zfp397Q7TNK4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zfp397Q7TNK4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zfp397Q7TNK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zfp397Q7TNK4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zfp397Q7TNK4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zfp397Q7TNK4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zfp397Q7TNK4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zfp397Q7TNK4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zfp397Q7TNK4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zfp397Q7TNK4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zfp397Q7TNK4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zfp397Q7TNK4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zfp397Q7TNK4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zfp397Q7TNK4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Zfp397Q7TNK4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zfp397Q7TNK4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zfp397Q7TNK4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zfp397Q7TNK4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zfp397Q7TNK4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zfp397Q7TNK4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Zfp397Q7TNK4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zfp397Q7TNK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zfp397Q7TNK4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zfp397Q7TNK4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zfp397Q7TNK4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zfp397Q7TNK4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zfp397Q7TNK4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zfp397Q7TNK4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zfp397Q7TNK4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zfp397Q7TNK4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zfp397Q7TNK4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zfp397Q7TNK4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zfp397Q7TNK4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zfp397Q7TNK4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zfp397Q7TNK4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zfp397Q7TNK4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zfp397Q7TNK4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zfp397Q7TNK4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Zfp397Q7TNK4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Zfp397Q7TNK4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zfp397Q7TNK4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zfp397Q7TNK4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zfp397Q7TNK4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zfp397Q7TNK4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zfp397Q7TNK4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zfp397Q7TNK4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zfp397Q7TNK4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zfp397Q7TNK4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zfp397Q7TNK4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zfp397Q7TNK4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zfp397Q7TNK4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Zfp397Q7TNK4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Zfp397Q7TNK4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Zfp397Q7TNK4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Zfp397Q7TNK4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zfp397Q7TNK4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zfp397Q7TNK4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp397Q7TNK4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Zfp397Q7TNK4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zfp397Q7TNK4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Zfp397Q7TNK4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zfp397Q7TNK4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zfp397Q7TNK4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zfp397Q7TNK4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms