Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SugctQ7TNE1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SugctQ7TNE1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SugctQ7TNE1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SugctQ7TNE1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SugctQ7TNE1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SugctQ7TNE1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SugctQ7TNE1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SugctQ7TNE1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SugctQ7TNE1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SugctQ7TNE1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SugctQ7TNE1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SugctQ7TNE1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SugctQ7TNE1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SugctQ7TNE1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SugctQ7TNE1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SugctQ7TNE1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SugctQ7TNE1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SugctQ7TNE1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SugctQ7TNE1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SugctQ7TNE1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SugctQ7TNE1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SugctQ7TNE1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SugctQ7TNE1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SugctQ7TNE1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SugctQ7TNE1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SugctQ7TNE1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SugctQ7TNE1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SugctQ7TNE1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SugctQ7TNE1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SugctQ7TNE1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SugctQ7TNE1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SugctQ7TNE1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SugctQ7TNE1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SugctQ7TNE1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SugctQ7TNE1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SugctQ7TNE1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SugctQ7TNE1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SugctQ7TNE1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SugctQ7TNE1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SugctQ7TNE1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SugctQ7TNE1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SugctQ7TNE1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SugctQ7TNE1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SugctQ7TNE1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SugctQ7TNE1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SugctQ7TNE1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SugctQ7TNE1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SugctQ7TNE1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SugctQ7TNE1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SugctQ7TNE1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SugctQ7TNE1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SugctQ7TNE1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SugctQ7TNE1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SugctQ7TNE1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SugctQ7TNE1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SugctQ7TNE1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SugctQ7TNE1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SugctQ7TNE1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SugctQ7TNE1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SugctQ7TNE1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SugctQ7TNE1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SugctQ7TNE1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SugctQ7TNE1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SugctQ7TNE1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SugctQ7TNE1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SugctQ7TNE1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SugctQ7TNE1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SugctQ7TNE1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SugctQ7TNE1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SugctQ7TNE1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SugctQ7TNE1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SugctQ7TNE1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SugctQ7TNE1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SugctQ7TNE1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SugctQ7TNE1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SugctQ7TNE1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SugctQ7TNE1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SugctQ7TNE1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SugctQ7TNE1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SugctQ7TNE1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SugctQ7TNE1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SugctQ7TNE1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SugctQ7TNE1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SugctQ7TNE1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SugctQ7TNE1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SugctQ7TNE1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SugctQ7TNE1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SugctQ7TNE1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SugctQ7TNE1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SugctQ7TNE1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SugctQ7TNE1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SugctQ7TNE1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SugctQ7TNE1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SugctQ7TNE1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SugctQ7TNE1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SugctQ7TNE1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SugctQ7TNE1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SugctQ7TNE1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SugctQ7TNE1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms