Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cxcl3Q6W5C0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cxcl3Q6W5C0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cxcl3Q6W5C0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cxcl3Q6W5C0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cxcl3Q6W5C0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cxcl3Q6W5C0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxcl3Q6W5C0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cxcl3Q6W5C0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cxcl3Q6W5C0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cxcl3Q6W5C0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl3Q6W5C0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cxcl3Q6W5C0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cxcl3Q6W5C0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cxcl3Q6W5C0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cxcl3Q6W5C0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cxcl3Q6W5C0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl3Q6W5C0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl3Q6W5C0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl3Q6W5C0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl3Q6W5C0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxcl3Q6W5C0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl3Q6W5C0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl3Q6W5C0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl3Q6W5C0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcl3Q6W5C0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxcl3Q6W5C0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cxcl3Q6W5C0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxcl3Q6W5C0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxcl3Q6W5C0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cxcl3Q6W5C0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cxcl3Q6W5C0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cxcl3Q6W5C0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cxcl3Q6W5C0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcl3Q6W5C0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cxcl3Q6W5C0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxcl3Q6W5C0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cxcl3Q6W5C0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cxcl3Q6W5C0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cxcl3Q6W5C0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cxcl3Q6W5C0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcl3Q6W5C0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cxcl3Q6W5C0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cxcl3Q6W5C0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cxcl3Q6W5C0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cxcl3Q6W5C0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cxcl3Q6W5C0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cxcl3Q6W5C0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cxcl3Q6W5C0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cxcl3Q6W5C0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cxcl3Q6W5C0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cxcl3Q6W5C0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cxcl3Q6W5C0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cxcl3Q6W5C0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cxcl3Q6W5C0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cxcl3Q6W5C0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cxcl3Q6W5C0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cxcl3Q6W5C0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cxcl3Q6W5C0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcl3Q6W5C0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cxcl3Q6W5C0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcl3Q6W5C0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cxcl3Q6W5C0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl3Q6W5C0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cxcl3Q6W5C0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cxcl3Q6W5C0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl3Q6W5C0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cxcl3Q6W5C0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cxcl3Q6W5C0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cxcl3Q6W5C0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cxcl3Q6W5C0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl3Q6W5C0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcl3Q6W5C0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl3Q6W5C0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cxcl3Q6W5C0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cxcl3Q6W5C0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcl3Q6W5C0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cxcl3Q6W5C0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcl3Q6W5C0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cxcl3Q6W5C0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl3Q6W5C0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cxcl3Q6W5C0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl3Q6W5C0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl3Q6W5C0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl3Q6W5C0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cxcl3Q6W5C0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcl3Q6W5C0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl3Q6W5C0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cxcl3Q6W5C0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxcl3Q6W5C0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxcl3Q6W5C0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms