Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd300ld3Q6SJQ5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cd300ld3Q6SJQ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd300ld3Q6SJQ5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd300ld3Q6SJQ5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd300ld3Q6SJQ5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd300ld3Q6SJQ5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd300ld3Q6SJQ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd300ld3Q6SJQ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd300ld3Q6SJQ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd300ld3Q6SJQ5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd300ld3Q6SJQ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd300ld3Q6SJQ5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd300ld3Q6SJQ5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd300ld3Q6SJQ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd300ld3Q6SJQ5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd300ld3Q6SJQ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd300ld3Q6SJQ5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd300ld3Q6SJQ5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cd300ld3Q6SJQ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cd300ld3Q6SJQ5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cd300ld3Q6SJQ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd300ld3Q6SJQ5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd300ld3Q6SJQ5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd300ld3Q6SJQ5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd300ld3Q6SJQ5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd300ld3Q6SJQ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cd300ld3Q6SJQ5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd300ld3Q6SJQ5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd300ld3Q6SJQ5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd300ld3Q6SJQ5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd300ld3Q6SJQ5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd300ld3Q6SJQ5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cd300ld3Q6SJQ5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd300ld3Q6SJQ5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd300ld3Q6SJQ5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd300ld3Q6SJQ5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd300ld3Q6SJQ5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300ld3Q6SJQ5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.7 ms