Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp1a2Q6PIE5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Atp1a2Q6PIE5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp1a2Q6PIE5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp1a2Q6PIE5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp1a2Q6PIE5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1a2Q6PIE5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1a2Q6PIE5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1a2Q6PIE5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp1a2Q6PIE5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp1a2Q6PIE5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp1a2Q6PIE5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp1a2Q6PIE5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp1a2Q6PIE5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1a2Q6PIE5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1a2Q6PIE5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1a2Q6PIE5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp1a2Q6PIE5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Atp1a2Q6PIE5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atp1a2Q6PIE5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Atp1a2Q6PIE5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Atp1a2Q6PIE5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Atp1a2Q6PIE5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Atp1a2Q6PIE5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Atp1a2Q6PIE5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Atp1a2Q6PIE5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atp1a2Q6PIE5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atp1a2Q6PIE5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Atp1a2Q6PIE5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp1a2Q6PIE5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1a2Q6PIE5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1a2Q6PIE5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1a2Q6PIE5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1a2Q6PIE5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1a2Q6PIE5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1a2Q6PIE5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp1a2Q6PIE5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp1a2Q6PIE5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atp1a2Q6PIE5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atp1a2Q6PIE5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atp1a2Q6PIE5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1a2Q6PIE5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atp1a2Q6PIE5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1a2Q6PIE5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atp1a2Q6PIE5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atp1a2Q6PIE5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1a2Q6PIE5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1a2Q6PIE5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1a2Q6PIE5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atp1a2Q6PIE5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atp1a2Q6PIE5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atp1a2Q6PIE5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1a2Q6PIE5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atp1a2Q6PIE5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atp1a2Q6PIE5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Atp1a2Q6PIE5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atp1a2Q6PIE5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atp1a2Q6PIE5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1a2Q6PIE5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atp1a2Q6PIE5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atp1a2Q6PIE5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atp1a2Q6PIE5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1a2Q6PIE5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atp1a2Q6PIE5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atp1a2Q6PIE5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp1a2Q6PIE5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp1a2Q6PIE5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp1a2Q6PIE5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp1a2Q6PIE5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1a2Q6PIE5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp1a2Q6PIE5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp1a2Q6PIE5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp1a2Q6PIE5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp1a2Q6PIE5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp1a2Q6PIE5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp1a2Q6PIE5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp1a2Q6PIE5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp1a2Q6PIE5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp1a2Q6PIE5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp1a2Q6PIE5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp1a2Q6PIE5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp1a2Q6PIE5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp1a2Q6PIE5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp1a2Q6PIE5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp1a2Q6PIE5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp1a2Q6PIE5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp1a2Q6PIE5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp1a2Q6PIE5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1a2Q6PIE5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms