Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc36Q6PDM4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc36Q6PDM4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc36Q6PDM4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc36Q6PDM4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc36Q6PDM4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc36Q6PDM4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc36Q6PDM4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc36Q6PDM4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc36Q6PDM4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc36Q6PDM4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc36Q6PDM4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc36Q6PDM4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc36Q6PDM4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc36Q6PDM4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc36Q6PDM4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc36Q6PDM4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc36Q6PDM4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc36Q6PDM4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc36Q6PDM4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc36Q6PDM4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc36Q6PDM4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc36Q6PDM4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc36Q6PDM4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc36Q6PDM4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc36Q6PDM4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc36Q6PDM4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc36Q6PDM4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc36Q6PDM4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc36Q6PDM4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc36Q6PDM4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc36Q6PDM4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc36Q6PDM4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc36Q6PDM4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc36Q6PDM4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc36Q6PDM4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc36Q6PDM4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc36Q6PDM4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc36Q6PDM4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc36Q6PDM4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc36Q6PDM4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc36Q6PDM4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc36Q6PDM4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc36Q6PDM4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc36Q6PDM4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc36Q6PDM4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc36Q6PDM4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc36Q6PDM4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc36Q6PDM4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc36Q6PDM4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc36Q6PDM4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc36Q6PDM4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc36Q6PDM4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc36Q6PDM4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc36Q6PDM4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc36Q6PDM4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc36Q6PDM4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc36Q6PDM4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc36Q6PDM4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc36Q6PDM4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc36Q6PDM4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc36Q6PDM4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc36Q6PDM4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc36Q6PDM4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc36Q6PDM4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc36Q6PDM4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc36Q6PDM4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc36Q6PDM4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc36Q6PDM4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc36Q6PDM4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc36Q6PDM4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc36Q6PDM4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc36Q6PDM4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms