Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt72Q6IME9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt72Q6IME9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt72Q6IME9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt72Q6IME9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt72Q6IME9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt72Q6IME9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt72Q6IME9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt72Q6IME9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt72Q6IME9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt72Q6IME9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt72Q6IME9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt72Q6IME9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt72Q6IME9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt72Q6IME9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt72Q6IME9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt72Q6IME9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt72Q6IME9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt72Q6IME9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt72Q6IME9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt72Q6IME9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt72Q6IME9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt72Q6IME9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt72Q6IME9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt72Q6IME9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt72Q6IME9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt72Q6IME9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt72Q6IME9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt72Q6IME9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt72Q6IME9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt72Q6IME9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt72Q6IME9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt72Q6IME9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt72Q6IME9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt72Q6IME9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt72Q6IME9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt72Q6IME9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt72Q6IME9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt72Q6IME9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt72Q6IME9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt72Q6IME9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt72Q6IME9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt72Q6IME9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt72Q6IME9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt72Q6IME9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt72Q6IME9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt72Q6IME9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt72Q6IME9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt72Q6IME9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt72Q6IME9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt72Q6IME9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt72Q6IME9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt72Q6IME9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt72Q6IME9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt72Q6IME9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt72Q6IME9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt72Q6IME9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt72Q6IME9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt72Q6IME9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt72Q6IME9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt72Q6IME9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt72Q6IME9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt72Q6IME9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt72Q6IME9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt72Q6IME9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Krt72Q6IME9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt72Q6IME9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt72Q6IME9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt72Q6IME9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt72Q6IME9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt72Q6IME9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt72Q6IME9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt72Q6IME9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt72Q6IME9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt72Q6IME9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt72Q6IME9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt72Q6IME9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt72Q6IME9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt72Q6IME9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt72Q6IME9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt72Q6IME9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt72Q6IME9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt72Q6IME9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt72Q6IME9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt72Q6IME9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt72Q6IME9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt72Q6IME9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt72Q6IME9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt72Q6IME9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt72Q6IME9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt72Q6IME9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt72Q6IME9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt72Q6IME9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt72Q6IME9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms