Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Brsk2Q69Z98 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Brsk2Q69Z98 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brsk2Q69Z98 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brsk2Q69Z98 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brsk2Q69Z98 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Brsk2Q69Z98 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.53■■■□□ 2
Brsk2Q69Z98 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brsk2Q69Z98 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Brsk2Q69Z98 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brsk2Q69Z98 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brsk2Q69Z98 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brsk2Q69Z98 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brsk2Q69Z98 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brsk2Q69Z98 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brsk2Q69Z98 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brsk2Q69Z98 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brsk2Q69Z98 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brsk2Q69Z98 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brsk2Q69Z98 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Brsk2Q69Z98 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brsk2Q69Z98 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Brsk2Q69Z98 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brsk2Q69Z98 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brsk2Q69Z98 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brsk2Q69Z98 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brsk2Q69Z98 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brsk2Q69Z98 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brsk2Q69Z98 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brsk2Q69Z98 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brsk2Q69Z98 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brsk2Q69Z98 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brsk2Q69Z98 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brsk2Q69Z98 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brsk2Q69Z98 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brsk2Q69Z98 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brsk2Q69Z98 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brsk2Q69Z98 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brsk2Q69Z98 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Brsk2Q69Z98 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brsk2Q69Z98 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brsk2Q69Z98 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brsk2Q69Z98 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brsk2Q69Z98 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brsk2Q69Z98 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Brsk2Q69Z98 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brsk2Q69Z98 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brsk2Q69Z98 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brsk2Q69Z98 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brsk2Q69Z98 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brsk2Q69Z98 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brsk2Q69Z98 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brsk2Q69Z98 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Brsk2Q69Z98 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Brsk2Q69Z98 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Brsk2Q69Z98 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brsk2Q69Z98 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Brsk2Q69Z98 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brsk2Q69Z98 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brsk2Q69Z98 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brsk2Q69Z98 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brsk2Q69Z98 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brsk2Q69Z98 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brsk2Q69Z98 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brsk2Q69Z98 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brsk2Q69Z98 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brsk2Q69Z98 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brsk2Q69Z98 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brsk2Q69Z98 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brsk2Q69Z98 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brsk2Q69Z98 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brsk2Q69Z98 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Brsk2Q69Z98 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brsk2Q69Z98 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brsk2Q69Z98 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brsk2Q69Z98 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brsk2Q69Z98 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brsk2Q69Z98 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brsk2Q69Z98 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brsk2Q69Z98 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Brsk2Q69Z98 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brsk2Q69Z98 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brsk2Q69Z98 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brsk2Q69Z98 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brsk2Q69Z98 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brsk2Q69Z98 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brsk2Q69Z98 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Brsk2Q69Z98 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brsk2Q69Z98 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brsk2Q69Z98 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brsk2Q69Z98 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brsk2Q69Z98 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brsk2Q69Z98 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Brsk2Q69Z98 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brsk2Q69Z98 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Brsk2Q69Z98 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Brsk2Q69Z98 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Brsk2Q69Z98 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Brsk2Q69Z98 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Brsk2Q69Z98 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms