Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tgfbr2Q62312 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfbr2Q62312 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tgfbr2Q62312 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tgfbr2Q62312 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfbr2Q62312 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfbr2Q62312 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfbr2Q62312 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfbr2Q62312 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfbr2Q62312 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfbr2Q62312 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfbr2Q62312 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfbr2Q62312 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tgfbr2Q62312 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfbr2Q62312 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tgfbr2Q62312 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfbr2Q62312 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfbr2Q62312 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tgfbr2Q62312 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfbr2Q62312 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfbr2Q62312 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfbr2Q62312 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfbr2Q62312 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfbr2Q62312 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfbr2Q62312 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tgfbr2Q62312 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfbr2Q62312 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfbr2Q62312 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfbr2Q62312 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgfbr2Q62312 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgfbr2Q62312 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgfbr2Q62312 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgfbr2Q62312 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgfbr2Q62312 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tgfbr2Q62312 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgfbr2Q62312 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgfbr2Q62312 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfbr2Q62312 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgfbr2Q62312 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfbr2Q62312 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgfbr2Q62312 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfbr2Q62312 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfbr2Q62312 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfbr2Q62312 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfbr2Q62312 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfbr2Q62312 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgfbr2Q62312 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfbr2Q62312 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfbr2Q62312 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfbr2Q62312 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfbr2Q62312 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfbr2Q62312 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfbr2Q62312 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfbr2Q62312 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfbr2Q62312 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfbr2Q62312 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfbr2Q62312 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfbr2Q62312 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfbr2Q62312 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfbr2Q62312 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfbr2Q62312 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfbr2Q62312 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tgfbr2Q62312 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tgfbr2Q62312 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgfbr2Q62312 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tgfbr2Q62312 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfbr2Q62312 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tgfbr2Q62312 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr2Q62312 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tgfbr2Q62312 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfbr2Q62312 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tgfbr2Q62312 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfbr2Q62312 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfbr2Q62312 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tgfbr2Q62312 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tgfbr2Q62312 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tgfbr2Q62312 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfbr2Q62312 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tgfbr2Q62312 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfbr2Q62312 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfbr2Q62312 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfbr2Q62312 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfbr2Q62312 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfbr2Q62312 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tgfbr2Q62312 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfbr2Q62312 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfbr2Q62312 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfbr2Q62312 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms