Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd47Q61735 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd47Q61735 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd47Q61735 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd47Q61735 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd47Q61735 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd47Q61735 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd47Q61735 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd47Q61735 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd47Q61735 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd47Q61735 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd47Q61735 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd47Q61735 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cd47Q61735 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd47Q61735 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd47Q61735 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cd47Q61735 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd47Q61735 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd47Q61735 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd47Q61735 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd47Q61735 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cd47Q61735 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cd47Q61735 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd47Q61735 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd47Q61735 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd47Q61735 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd47Q61735 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd47Q61735 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd47Q61735 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd47Q61735 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd47Q61735 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd47Q61735 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd47Q61735 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd47Q61735 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd47Q61735 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd47Q61735 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd47Q61735 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd47Q61735 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd47Q61735 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd47Q61735 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd47Q61735 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd47Q61735 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd47Q61735 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd47Q61735 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd47Q61735 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd47Q61735 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd47Q61735 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd47Q61735 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd47Q61735 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd47Q61735 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd47Q61735 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd47Q61735 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd47Q61735 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd47Q61735 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd47Q61735 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd47Q61735 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd47Q61735 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd47Q61735 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd47Q61735 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd47Q61735 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd47Q61735 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd47Q61735 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd47Q61735 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd47Q61735 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd47Q61735 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd47Q61735 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd47Q61735 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd47Q61735 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd47Q61735 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd47Q61735 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd47Q61735 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd47Q61735 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd47Q61735 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd47Q61735 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd47Q61735 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd47Q61735 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd47Q61735 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd47Q61735 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd47Q61735 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd47Q61735 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd47Q61735 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd47Q61735 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd47Q61735 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd47Q61735 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd47Q61735 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd47Q61735 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd47Q61735 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd47Q61735 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd47Q61735 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd47Q61735 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd47Q61735 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd47Q61735 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd47Q61735 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd47Q61735 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd47Q61735 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd47Q61735 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd47Q61735 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd47Q61735 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd47Q61735 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd47Q61735 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.4 ms