Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Acvr1bQ61271 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Acvr1bQ61271 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Acvr1bQ61271 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Acvr1bQ61271 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acvr1bQ61271 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Acvr1bQ61271 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Acvr1bQ61271 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Acvr1bQ61271 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Acvr1bQ61271 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Acvr1bQ61271 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Acvr1bQ61271 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acvr1bQ61271 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Acvr1bQ61271 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Acvr1bQ61271 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acvr1bQ61271 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Acvr1bQ61271 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Acvr1bQ61271 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Acvr1bQ61271 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acvr1bQ61271 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acvr1bQ61271 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acvr1bQ61271 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acvr1bQ61271 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acvr1bQ61271 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acvr1bQ61271 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acvr1bQ61271 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acvr1bQ61271 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acvr1bQ61271 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Acvr1bQ61271 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acvr1bQ61271 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acvr1bQ61271 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acvr1bQ61271 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acvr1bQ61271 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acvr1bQ61271 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acvr1bQ61271 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acvr1bQ61271 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acvr1bQ61271 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acvr1bQ61271 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acvr1bQ61271 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acvr1bQ61271 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acvr1bQ61271 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acvr1bQ61271 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acvr1bQ61271 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acvr1bQ61271 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Acvr1bQ61271 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acvr1bQ61271 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acvr1bQ61271 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acvr1bQ61271 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acvr1bQ61271 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acvr1bQ61271 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acvr1bQ61271 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Acvr1bQ61271 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Acvr1bQ61271 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acvr1bQ61271 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acvr1bQ61271 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acvr1bQ61271 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acvr1bQ61271 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acvr1bQ61271 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acvr1bQ61271 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acvr1bQ61271 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acvr1bQ61271 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Acvr1bQ61271 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Acvr1bQ61271 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acvr1bQ61271 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Acvr1bQ61271 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Acvr1bQ61271 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Acvr1bQ61271 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acvr1bQ61271 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acvr1bQ61271 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acvr1bQ61271 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Acvr1bQ61271 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acvr1bQ61271 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acvr1bQ61271 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acvr1bQ61271 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Acvr1bQ61271 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Acvr1bQ61271 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Acvr1bQ61271 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acvr1bQ61271 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acvr1bQ61271 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Acvr1bQ61271 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Acvr1bQ61271 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Acvr1bQ61271 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Acvr1bQ61271 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Acvr1bQ61271 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Acvr1bQ61271 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Acvr1bQ61271 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Acvr1bQ61271 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acvr1bQ61271 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acvr1bQ61271 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acvr1bQ61271 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acvr1bQ61271 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acvr1bQ61271 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acvr1bQ61271 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acvr1bQ61271 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acvr1bQ61271 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Acvr1bQ61271 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Acvr1bQ61271 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acvr1bQ61271 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acvr1bQ61271 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Acvr1bQ61271 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms