Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmb6Q60692 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmb6Q60692 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmb6Q60692 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Psmb6Q60692 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb6Q60692 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb6Q60692 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb6Q60692 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmb6Q60692 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmb6Q60692 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb6Q60692 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb6Q60692 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmb6Q60692 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb6Q60692 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb6Q60692 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb6Q60692 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb6Q60692 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb6Q60692 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb6Q60692 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb6Q60692 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb6Q60692 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmb6Q60692 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmb6Q60692 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb6Q60692 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb6Q60692 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb6Q60692 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb6Q60692 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb6Q60692 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmb6Q60692 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psmb6Q60692 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb6Q60692 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb6Q60692 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb6Q60692 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb6Q60692 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb6Q60692 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb6Q60692 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb6Q60692 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb6Q60692 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb6Q60692 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb6Q60692 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Psmb6Q60692 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Psmb6Q60692 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb6Q60692 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Psmb6Q60692 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb6Q60692 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Psmb6Q60692 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb6Q60692 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Psmb6Q60692 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psmb6Q60692 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb6Q60692 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb6Q60692 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb6Q60692 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb6Q60692 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psmb6Q60692 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psmb6Q60692 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb6Q60692 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb6Q60692 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb6Q60692 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb6Q60692 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb6Q60692 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb6Q60692 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmb6Q60692 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmb6Q60692 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psmb6Q60692 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmb6Q60692 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psmb6Q60692 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psmb6Q60692 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psmb6Q60692 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psmb6Q60692 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psmb6Q60692 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psmb6Q60692 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb6Q60692 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psmb6Q60692 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb6Q60692 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb6Q60692 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb6Q60692 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb6Q60692 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb6Q60692 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb6Q60692 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psmb6Q60692 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms