Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sft2d1Q5SSN7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sft2d1Q5SSN7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sft2d1Q5SSN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sft2d1Q5SSN7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sft2d1Q5SSN7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sft2d1Q5SSN7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sft2d1Q5SSN7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sft2d1Q5SSN7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sft2d1Q5SSN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sft2d1Q5SSN7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sft2d1Q5SSN7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sft2d1Q5SSN7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sft2d1Q5SSN7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sft2d1Q5SSN7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sft2d1Q5SSN7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sft2d1Q5SSN7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sft2d1Q5SSN7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sft2d1Q5SSN7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sft2d1Q5SSN7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sft2d1Q5SSN7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sft2d1Q5SSN7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sft2d1Q5SSN7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sft2d1Q5SSN7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sft2d1Q5SSN7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sft2d1Q5SSN7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sft2d1Q5SSN7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sft2d1Q5SSN7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sft2d1Q5SSN7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sft2d1Q5SSN7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sft2d1Q5SSN7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sft2d1Q5SSN7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sft2d1Q5SSN7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sft2d1Q5SSN7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sft2d1Q5SSN7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sft2d1Q5SSN7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sft2d1Q5SSN7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sft2d1Q5SSN7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sft2d1Q5SSN7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sft2d1Q5SSN7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sft2d1Q5SSN7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sft2d1Q5SSN7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sft2d1Q5SSN7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sft2d1Q5SSN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sft2d1Q5SSN7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sft2d1Q5SSN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sft2d1Q5SSN7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sft2d1Q5SSN7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sft2d1Q5SSN7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sft2d1Q5SSN7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sft2d1Q5SSN7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sft2d1Q5SSN7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sft2d1Q5SSN7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sft2d1Q5SSN7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sft2d1Q5SSN7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sft2d1Q5SSN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sft2d1Q5SSN7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sft2d1Q5SSN7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sft2d1Q5SSN7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sft2d1Q5SSN7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sft2d1Q5SSN7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sft2d1Q5SSN7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sft2d1Q5SSN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sft2d1Q5SSN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sft2d1Q5SSN7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sft2d1Q5SSN7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sft2d1Q5SSN7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sft2d1Q5SSN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sft2d1Q5SSN7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sft2d1Q5SSN7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sft2d1Q5SSN7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sft2d1Q5SSN7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sft2d1Q5SSN7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms