Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdr39u1Q5M8N4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr39u1Q5M8N4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr39u1Q5M8N4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr39u1Q5M8N4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr39u1Q5M8N4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr39u1Q5M8N4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr39u1Q5M8N4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr39u1Q5M8N4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr39u1Q5M8N4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr39u1Q5M8N4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdr39u1Q5M8N4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdr39u1Q5M8N4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdr39u1Q5M8N4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdr39u1Q5M8N4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr39u1Q5M8N4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr39u1Q5M8N4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdr39u1Q5M8N4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdr39u1Q5M8N4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdr39u1Q5M8N4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdr39u1Q5M8N4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdr39u1Q5M8N4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sdr39u1Q5M8N4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdr39u1Q5M8N4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr39u1Q5M8N4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdr39u1Q5M8N4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdr39u1Q5M8N4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdr39u1Q5M8N4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr39u1Q5M8N4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sdr39u1Q5M8N4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr39u1Q5M8N4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr39u1Q5M8N4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr39u1Q5M8N4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sdr39u1Q5M8N4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sdr39u1Q5M8N4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdr39u1Q5M8N4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sdr39u1Q5M8N4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sdr39u1Q5M8N4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sdr39u1Q5M8N4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sdr39u1Q5M8N4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sdr39u1Q5M8N4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr39u1Q5M8N4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sdr39u1Q5M8N4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr39u1Q5M8N4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sdr39u1Q5M8N4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sdr39u1Q5M8N4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sdr39u1Q5M8N4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr39u1Q5M8N4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sdr39u1Q5M8N4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sdr39u1Q5M8N4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sdr39u1Q5M8N4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sdr39u1Q5M8N4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdr39u1Q5M8N4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdr39u1Q5M8N4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdr39u1Q5M8N4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr39u1Q5M8N4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdr39u1Q5M8N4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdr39u1Q5M8N4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdr39u1Q5M8N4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdr39u1Q5M8N4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdr39u1Q5M8N4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdr39u1Q5M8N4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdr39u1Q5M8N4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdr39u1Q5M8N4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdr39u1Q5M8N4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sdr39u1Q5M8N4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sdr39u1Q5M8N4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr39u1Q5M8N4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sdr39u1Q5M8N4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sdr39u1Q5M8N4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sdr39u1Q5M8N4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sdr39u1Q5M8N4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr39u1Q5M8N4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sdr39u1Q5M8N4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sdr39u1Q5M8N4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sdr39u1Q5M8N4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdr39u1Q5M8N4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdr39u1Q5M8N4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdr39u1Q5M8N4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr39u1Q5M8N4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr39u1Q5M8N4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr39u1Q5M8N4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr39u1Q5M8N4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr39u1Q5M8N4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr39u1Q5M8N4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdr39u1Q5M8N4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdr39u1Q5M8N4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdr39u1Q5M8N4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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