Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prkaa1Q5EG47 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prkaa1Q5EG47 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prkaa1Q5EG47 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prkaa1Q5EG47 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prkaa1Q5EG47 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prkaa1Q5EG47 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkaa1Q5EG47 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prkaa1Q5EG47 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Prkaa1Q5EG47 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prkaa1Q5EG47 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prkaa1Q5EG47 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Prkaa1Q5EG47 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prkaa1Q5EG47 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prkaa1Q5EG47 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prkaa1Q5EG47 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prkaa1Q5EG47 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prkaa1Q5EG47 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Prkaa1Q5EG47 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prkaa1Q5EG47 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Prkaa1Q5EG47 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prkaa1Q5EG47 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prkaa1Q5EG47 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Prkaa1Q5EG47 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Prkaa1Q5EG47 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Prkaa1Q5EG47 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prkaa1Q5EG47 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prkaa1Q5EG47 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prkaa1Q5EG47 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Prkaa1Q5EG47 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkaa1Q5EG47 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prkaa1Q5EG47 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkaa1Q5EG47 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkaa1Q5EG47 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkaa1Q5EG47 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkaa1Q5EG47 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkaa1Q5EG47 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkaa1Q5EG47 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkaa1Q5EG47 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkaa1Q5EG47 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkaa1Q5EG47 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prkaa1Q5EG47 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkaa1Q5EG47 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Prkaa1Q5EG47 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkaa1Q5EG47 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prkaa1Q5EG47 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkaa1Q5EG47 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkaa1Q5EG47 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkaa1Q5EG47 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkaa1Q5EG47 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkaa1Q5EG47 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prkaa1Q5EG47 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Prkaa1Q5EG47 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkaa1Q5EG47 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkaa1Q5EG47 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prkaa1Q5EG47 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Prkaa1Q5EG47 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Prkaa1Q5EG47 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Prkaa1Q5EG47 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prkaa1Q5EG47 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prkaa1Q5EG47 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Prkaa1Q5EG47 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prkaa1Q5EG47 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkaa1Q5EG47 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prkaa1Q5EG47 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Prkaa1Q5EG47 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Prkaa1Q5EG47 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkaa1Q5EG47 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkaa1Q5EG47 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prkaa1Q5EG47 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prkaa1Q5EG47 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prkaa1Q5EG47 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prkaa1Q5EG47 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prkaa1Q5EG47 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkaa1Q5EG47 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prkaa1Q5EG47 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prkaa1Q5EG47 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prkaa1Q5EG47 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prkaa1Q5EG47 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prkaa1Q5EG47 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prkaa1Q5EG47 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prkaa1Q5EG47 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prkaa1Q5EG47 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prkaa1Q5EG47 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prkaa1Q5EG47 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkaa1Q5EG47 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkaa1Q5EG47 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prkaa1Q5EG47 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkaa1Q5EG47 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prkaa1Q5EG47 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prkaa1Q5EG47 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prkaa1Q5EG47 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prkaa1Q5EG47 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prkaa1Q5EG47 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prkaa1Q5EG47 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prkaa1Q5EG47 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prkaa1Q5EG47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prkaa1Q5EG47 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms