Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam220aQ3ZN08 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam220aQ3ZN08 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam220aQ3ZN08 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam220aQ3ZN08 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam220aQ3ZN08 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam220aQ3ZN08 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam220aQ3ZN08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam220aQ3ZN08 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam220aQ3ZN08 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam220aQ3ZN08 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam220aQ3ZN08 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam220aQ3ZN08 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam220aQ3ZN08 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam220aQ3ZN08 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam220aQ3ZN08 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam220aQ3ZN08 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam220aQ3ZN08 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam220aQ3ZN08 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam220aQ3ZN08 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam220aQ3ZN08 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam220aQ3ZN08 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam220aQ3ZN08 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam220aQ3ZN08 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam220aQ3ZN08 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam220aQ3ZN08 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam220aQ3ZN08 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam220aQ3ZN08 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam220aQ3ZN08 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam220aQ3ZN08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam220aQ3ZN08 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam220aQ3ZN08 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam220aQ3ZN08 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam220aQ3ZN08 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam220aQ3ZN08 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam220aQ3ZN08 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam220aQ3ZN08 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam220aQ3ZN08 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam220aQ3ZN08 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam220aQ3ZN08 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam220aQ3ZN08 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam220aQ3ZN08 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam220aQ3ZN08 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam220aQ3ZN08 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam220aQ3ZN08 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam220aQ3ZN08 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam220aQ3ZN08 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam220aQ3ZN08 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam220aQ3ZN08 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam220aQ3ZN08 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam220aQ3ZN08 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam220aQ3ZN08 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam220aQ3ZN08 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam220aQ3ZN08 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam220aQ3ZN08 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam220aQ3ZN08 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam220aQ3ZN08 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam220aQ3ZN08 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam220aQ3ZN08 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam220aQ3ZN08 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam220aQ3ZN08 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam220aQ3ZN08 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam220aQ3ZN08 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam220aQ3ZN08 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam220aQ3ZN08 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam220aQ3ZN08 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam220aQ3ZN08 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam220aQ3ZN08 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam220aQ3ZN08 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam220aQ3ZN08 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam220aQ3ZN08 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam220aQ3ZN08 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam220aQ3ZN08 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam220aQ3ZN08 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam220aQ3ZN08 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam220aQ3ZN08 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam220aQ3ZN08 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam220aQ3ZN08 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam220aQ3ZN08 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam220aQ3ZN08 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam220aQ3ZN08 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam220aQ3ZN08 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam220aQ3ZN08 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam220aQ3ZN08 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam220aQ3ZN08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam220aQ3ZN08 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam220aQ3ZN08 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam220aQ3ZN08 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam220aQ3ZN08 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam220aQ3ZN08 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam220aQ3ZN08 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam220aQ3ZN08 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam220aQ3ZN08 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam220aQ3ZN08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam220aQ3ZN08 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam220aQ3ZN08 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam220aQ3ZN08 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam220aQ3ZN08 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam220aQ3ZN08 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms