Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
4930567H17RikQ3V0K5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
4930567H17RikQ3V0K5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
4930567H17RikQ3V0K5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
4930567H17RikQ3V0K5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
4930567H17RikQ3V0K5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
4930567H17RikQ3V0K5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
4930567H17RikQ3V0K5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
4930567H17RikQ3V0K5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
4930567H17RikQ3V0K5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
4930567H17RikQ3V0K5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
4930567H17RikQ3V0K5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
4930567H17RikQ3V0K5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
4930567H17RikQ3V0K5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
4930567H17RikQ3V0K5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
4930567H17RikQ3V0K5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
4930567H17RikQ3V0K5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
4930567H17RikQ3V0K5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
4930567H17RikQ3V0K5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
4930567H17RikQ3V0K5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
4930567H17RikQ3V0K5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
4930567H17RikQ3V0K5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
4930567H17RikQ3V0K5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
4930567H17RikQ3V0K5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
4930567H17RikQ3V0K5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
4930567H17RikQ3V0K5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
4930567H17RikQ3V0K5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
4930567H17RikQ3V0K5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
4930567H17RikQ3V0K5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
4930567H17RikQ3V0K5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
4930567H17RikQ3V0K5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
4930567H17RikQ3V0K5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
4930567H17RikQ3V0K5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
4930567H17RikQ3V0K5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
4930567H17RikQ3V0K5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
4930567H17RikQ3V0K5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
4930567H17RikQ3V0K5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
4930567H17RikQ3V0K5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
4930567H17RikQ3V0K5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
4930567H17RikQ3V0K5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
4930567H17RikQ3V0K5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
4930567H17RikQ3V0K5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
4930567H17RikQ3V0K5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
4930567H17RikQ3V0K5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
4930567H17RikQ3V0K5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
4930567H17RikQ3V0K5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
4930567H17RikQ3V0K5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
4930567H17RikQ3V0K5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
4930567H17RikQ3V0K5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
4930567H17RikQ3V0K5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
4930567H17RikQ3V0K5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
4930567H17RikQ3V0K5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
4930567H17RikQ3V0K5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
4930567H17RikQ3V0K5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
4930567H17RikQ3V0K5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
4930567H17RikQ3V0K5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
4930567H17RikQ3V0K5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
4930567H17RikQ3V0K5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
4930567H17RikQ3V0K5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
4930567H17RikQ3V0K5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
4930567H17RikQ3V0K5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
4930567H17RikQ3V0K5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
4930567H17RikQ3V0K5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
4930567H17RikQ3V0K5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
4930567H17RikQ3V0K5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
4930567H17RikQ3V0K5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
4930567H17RikQ3V0K5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
4930567H17RikQ3V0K5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
4930567H17RikQ3V0K5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
4930567H17RikQ3V0K5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
4930567H17RikQ3V0K5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
4930567H17RikQ3V0K5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
4930567H17RikQ3V0K5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
4930567H17RikQ3V0K5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
4930567H17RikQ3V0K5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
4930567H17RikQ3V0K5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
4930567H17RikQ3V0K5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
4930567H17RikQ3V0K5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
4930567H17RikQ3V0K5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
4930567H17RikQ3V0K5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms