Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm44Q3V089 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbm44Q3V089 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbm44Q3V089 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rbm44Q3V089 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rbm44Q3V089 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rbm44Q3V089 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbm44Q3V089 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbm44Q3V089 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rbm44Q3V089 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbm44Q3V089 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rbm44Q3V089 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbm44Q3V089 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbm44Q3V089 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbm44Q3V089 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rbm44Q3V089 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbm44Q3V089 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbm44Q3V089 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbm44Q3V089 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbm44Q3V089 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbm44Q3V089 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbm44Q3V089 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbm44Q3V089 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm44Q3V089 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm44Q3V089 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm44Q3V089 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm44Q3V089 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbm44Q3V089 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm44Q3V089 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbm44Q3V089 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm44Q3V089 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbm44Q3V089 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbm44Q3V089 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbm44Q3V089 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbm44Q3V089 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rbm44Q3V089 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbm44Q3V089 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbm44Q3V089 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbm44Q3V089 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbm44Q3V089 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbm44Q3V089 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm44Q3V089 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm44Q3V089 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm44Q3V089 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm44Q3V089 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbm44Q3V089 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm44Q3V089 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm44Q3V089 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbm44Q3V089 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbm44Q3V089 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbm44Q3V089 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbm44Q3V089 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbm44Q3V089 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rbm44Q3V089 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rbm44Q3V089 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbm44Q3V089 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbm44Q3V089 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbm44Q3V089 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbm44Q3V089 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbm44Q3V089 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm44Q3V089 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm44Q3V089 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm44Q3V089 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbm44Q3V089 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm44Q3V089 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rbm44Q3V089 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rbm44Q3V089 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rbm44Q3V089 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rbm44Q3V089 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rbm44Q3V089 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm44Q3V089 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rbm44Q3V089 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm44Q3V089 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm44Q3V089 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rbm44Q3V089 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm44Q3V089 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rbm44Q3V089 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rbm44Q3V089 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm44Q3V089 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rbm44Q3V089 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rbm44Q3V089 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm44Q3V089 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rbm44Q3V089 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rbm44Q3V089 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rbm44Q3V089 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm44Q3V089 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm44Q3V089 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rbm44Q3V089 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rbm44Q3V089 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm44Q3V089 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm44Q3V089 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm44Q3V089 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm44Q3V089 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm44Q3V089 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm44Q3V089 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm44Q3V089 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm44Q3V089 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm44Q3V089 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rbm44Q3V089 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbm44Q3V089 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms