Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc190Q3URK1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc190Q3URK1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc190Q3URK1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc190Q3URK1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc190Q3URK1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc190Q3URK1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc190Q3URK1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc190Q3URK1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc190Q3URK1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc190Q3URK1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc190Q3URK1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc190Q3URK1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc190Q3URK1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc190Q3URK1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc190Q3URK1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc190Q3URK1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc190Q3URK1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc190Q3URK1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc190Q3URK1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc190Q3URK1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc190Q3URK1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc190Q3URK1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc190Q3URK1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc190Q3URK1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc190Q3URK1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc190Q3URK1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc190Q3URK1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc190Q3URK1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc190Q3URK1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc190Q3URK1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc190Q3URK1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc190Q3URK1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc190Q3URK1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc190Q3URK1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc190Q3URK1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc190Q3URK1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc190Q3URK1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc190Q3URK1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc190Q3URK1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc190Q3URK1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc190Q3URK1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc190Q3URK1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc190Q3URK1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc190Q3URK1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc190Q3URK1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc190Q3URK1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc190Q3URK1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc190Q3URK1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc190Q3URK1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc190Q3URK1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc190Q3URK1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc190Q3URK1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc190Q3URK1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc190Q3URK1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc190Q3URK1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc190Q3URK1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc190Q3URK1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc190Q3URK1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc190Q3URK1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc190Q3URK1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc190Q3URK1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc190Q3URK1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc190Q3URK1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc190Q3URK1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc190Q3URK1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc190Q3URK1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc190Q3URK1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc190Q3URK1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc190Q3URK1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc190Q3URK1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc190Q3URK1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc190Q3URK1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc190Q3URK1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc190Q3URK1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc190Q3URK1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc190Q3URK1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc190Q3URK1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc190Q3URK1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc190Q3URK1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc190Q3URK1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc190Q3URK1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc190Q3URK1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc190Q3URK1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc190Q3URK1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc190Q3URK1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc190Q3URK1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc190Q3URK1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc190Q3URK1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc190Q3URK1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc190Q3URK1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc190Q3URK1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms