Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL6

Ms4a15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a15Q3UPL6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a15Q3UPL6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a15Q3UPL6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a15Q3UPL6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ms4a15Q3UPL6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a15Q3UPL6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a15Q3UPL6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ms4a15Q3UPL6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a15Q3UPL6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a15Q3UPL6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a15Q3UPL6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ms4a15Q3UPL6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a15Q3UPL6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ms4a15Q3UPL6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a15Q3UPL6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a15Q3UPL6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a15Q3UPL6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a15Q3UPL6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a15Q3UPL6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a15Q3UPL6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ms4a15Q3UPL6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a15Q3UPL6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a15Q3UPL6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a15Q3UPL6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ms4a15Q3UPL6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a15Q3UPL6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a15Q3UPL6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ms4a15Q3UPL6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ms4a15Q3UPL6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ms4a15Q3UPL6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a15Q3UPL6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a15Q3UPL6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a15Q3UPL6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ms4a15Q3UPL6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a15Q3UPL6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a15Q3UPL6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a15Q3UPL6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a15Q3UPL6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a15Q3UPL6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a15Q3UPL6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a15Q3UPL6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a15Q3UPL6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a15Q3UPL6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a15Q3UPL6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a15Q3UPL6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a15Q3UPL6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a15Q3UPL6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a15Q3UPL6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a15Q3UPL6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a15Q3UPL6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a15Q3UPL6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a15Q3UPL6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a15Q3UPL6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ms4a15Q3UPL6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ms4a15Q3UPL6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a15Q3UPL6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a15Q3UPL6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a15Q3UPL6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a15Q3UPL6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a15Q3UPL6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a15Q3UPL6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ms4a15Q3UPL6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ms4a15Q3UPL6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ms4a15Q3UPL6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ms4a15Q3UPL6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ms4a15Q3UPL6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a15Q3UPL6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a15Q3UPL6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a15Q3UPL6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a15Q3UPL6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a15Q3UPL6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a15Q3UPL6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ms4a15Q3UPL6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ms4a15Q3UPL6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a15Q3UPL6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a15Q3UPL6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a15Q3UPL6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a15Q3UPL6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ms4a15Q3UPL6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ms4a15Q3UPL6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ms4a15Q3UPL6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a15Q3UPL6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a15Q3UPL6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a15Q3UPL6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a15Q3UPL6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a15Q3UPL6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ms4a15Q3UPL6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ms4a15Q3UPL6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ms4a15Q3UPL6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ms4a15Q3UPL6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a15Q3UPL6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a15Q3UPL6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a15Q3UPL6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a15Q3UPL6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a15Q3UPL6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a15Q3UPL6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ms4a15Q3UPL6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a15Q3UPL6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ms4a15Q3UPL6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ms4a15Q3UPL6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms