Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lsg1Q3UM18 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lsg1Q3UM18 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lsg1Q3UM18 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lsg1Q3UM18 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lsg1Q3UM18 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lsg1Q3UM18 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lsg1Q3UM18 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lsg1Q3UM18 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lsg1Q3UM18 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lsg1Q3UM18 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lsg1Q3UM18 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lsg1Q3UM18 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lsg1Q3UM18 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lsg1Q3UM18 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lsg1Q3UM18 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lsg1Q3UM18 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lsg1Q3UM18 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lsg1Q3UM18 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lsg1Q3UM18 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lsg1Q3UM18 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lsg1Q3UM18 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lsg1Q3UM18 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lsg1Q3UM18 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lsg1Q3UM18 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lsg1Q3UM18 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lsg1Q3UM18 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lsg1Q3UM18 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lsg1Q3UM18 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lsg1Q3UM18 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lsg1Q3UM18 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lsg1Q3UM18 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lsg1Q3UM18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lsg1Q3UM18 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lsg1Q3UM18 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lsg1Q3UM18 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lsg1Q3UM18 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lsg1Q3UM18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lsg1Q3UM18 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lsg1Q3UM18 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lsg1Q3UM18 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lsg1Q3UM18 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lsg1Q3UM18 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lsg1Q3UM18 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lsg1Q3UM18 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lsg1Q3UM18 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lsg1Q3UM18 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lsg1Q3UM18 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lsg1Q3UM18 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lsg1Q3UM18 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lsg1Q3UM18 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lsg1Q3UM18 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lsg1Q3UM18 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lsg1Q3UM18 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lsg1Q3UM18 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lsg1Q3UM18 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lsg1Q3UM18 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lsg1Q3UM18 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lsg1Q3UM18 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lsg1Q3UM18 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lsg1Q3UM18 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lsg1Q3UM18 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lsg1Q3UM18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lsg1Q3UM18 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lsg1Q3UM18 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lsg1Q3UM18 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lsg1Q3UM18 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lsg1Q3UM18 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lsg1Q3UM18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lsg1Q3UM18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lsg1Q3UM18 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lsg1Q3UM18 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lsg1Q3UM18 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lsg1Q3UM18 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lsg1Q3UM18 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lsg1Q3UM18 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lsg1Q3UM18 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lsg1Q3UM18 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lsg1Q3UM18 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lsg1Q3UM18 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lsg1Q3UM18 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lsg1Q3UM18 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lsg1Q3UM18 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lsg1Q3UM18 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lsg1Q3UM18 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lsg1Q3UM18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lsg1Q3UM18 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lsg1Q3UM18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lsg1Q3UM18 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lsg1Q3UM18 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms