Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnft2Q3UF64 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnft2Q3UF64 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnft2Q3UF64 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnft2Q3UF64 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnft2Q3UF64 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnft2Q3UF64 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnft2Q3UF64 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnft2Q3UF64 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnft2Q3UF64 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnft2Q3UF64 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnft2Q3UF64 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnft2Q3UF64 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnft2Q3UF64 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnft2Q3UF64 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnft2Q3UF64 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnft2Q3UF64 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnft2Q3UF64 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnft2Q3UF64 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnft2Q3UF64 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnft2Q3UF64 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnft2Q3UF64 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnft2Q3UF64 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnft2Q3UF64 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnft2Q3UF64 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnft2Q3UF64 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnft2Q3UF64 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnft2Q3UF64 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnft2Q3UF64 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnft2Q3UF64 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnft2Q3UF64 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnft2Q3UF64 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnft2Q3UF64 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnft2Q3UF64 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnft2Q3UF64 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnft2Q3UF64 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnft2Q3UF64 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnft2Q3UF64 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnft2Q3UF64 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnft2Q3UF64 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnft2Q3UF64 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnft2Q3UF64 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnft2Q3UF64 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnft2Q3UF64 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnft2Q3UF64 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnft2Q3UF64 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnft2Q3UF64 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnft2Q3UF64 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnft2Q3UF64 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnft2Q3UF64 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnft2Q3UF64 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnft2Q3UF64 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnft2Q3UF64 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnft2Q3UF64 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnft2Q3UF64 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnft2Q3UF64 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnft2Q3UF64 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnft2Q3UF64 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnft2Q3UF64 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnft2Q3UF64 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnft2Q3UF64 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnft2Q3UF64 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnft2Q3UF64 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnft2Q3UF64 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnft2Q3UF64 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnft2Q3UF64 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnft2Q3UF64 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnft2Q3UF64 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnft2Q3UF64 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnft2Q3UF64 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnft2Q3UF64 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnft2Q3UF64 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnft2Q3UF64 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnft2Q3UF64 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnft2Q3UF64 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnft2Q3UF64 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnft2Q3UF64 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnft2Q3UF64 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnft2Q3UF64 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnft2Q3UF64 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnft2Q3UF64 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnft2Q3UF64 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnft2Q3UF64 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnft2Q3UF64 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnft2Q3UF64 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnft2Q3UF64 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnft2Q3UF64 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnft2Q3UF64 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnft2Q3UF64 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnft2Q3UF64 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms