Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cops9Q3U898 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cops9Q3U898 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cops9Q3U898 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cops9Q3U898 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cops9Q3U898 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cops9Q3U898 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cops9Q3U898 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cops9Q3U898 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cops9Q3U898 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cops9Q3U898 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cops9Q3U898 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cops9Q3U898 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cops9Q3U898 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops9Q3U898 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cops9Q3U898 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cops9Q3U898 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cops9Q3U898 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops9Q3U898 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops9Q3U898 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cops9Q3U898 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cops9Q3U898 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cops9Q3U898 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cops9Q3U898 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cops9Q3U898 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cops9Q3U898 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cops9Q3U898 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cops9Q3U898 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cops9Q3U898 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cops9Q3U898 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cops9Q3U898 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cops9Q3U898 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cops9Q3U898 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops9Q3U898 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cops9Q3U898 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops9Q3U898 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cops9Q3U898 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cops9Q3U898 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cops9Q3U898 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cops9Q3U898 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops9Q3U898 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops9Q3U898 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops9Q3U898 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops9Q3U898 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops9Q3U898 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cops9Q3U898 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cops9Q3U898 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cops9Q3U898 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops9Q3U898 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops9Q3U898 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cops9Q3U898 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops9Q3U898 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops9Q3U898 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops9Q3U898 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops9Q3U898 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops9Q3U898 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops9Q3U898 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops9Q3U898 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops9Q3U898 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops9Q3U898 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops9Q3U898 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops9Q3U898 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops9Q3U898 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops9Q3U898 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops9Q3U898 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops9Q3U898 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops9Q3U898 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cops9Q3U898 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cops9Q3U898 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops9Q3U898 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cops9Q3U898 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops9Q3U898 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops9Q3U898 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cops9Q3U898 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops9Q3U898 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops9Q3U898 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops9Q3U898 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops9Q3U898 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops9Q3U898 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cops9Q3U898 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops9Q3U898 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cops9Q3U898 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops9Q3U898 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops9Q3U898 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops9Q3U898 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops9Q3U898 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops9Q3U898 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops9Q3U898 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops9Q3U898 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cops9Q3U898 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cops9Q3U898 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops9Q3U898 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops9Q3U898 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cops9Q3U898 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cops9Q3U898 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cops9Q3U898 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cops9Q3U898 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cops9Q3U898 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cops9Q3U898 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cops9Q3U898 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms