Protein–RNA interactions for Protein: Q3U564

Dcp1b, mRNA-decapping enzyme 1B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcp1bQ3U564 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dcp1bQ3U564 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dcp1bQ3U564 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dcp1bQ3U564 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dcp1bQ3U564 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dcp1bQ3U564 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dcp1bQ3U564 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dcp1bQ3U564 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dcp1bQ3U564 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dcp1bQ3U564 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dcp1bQ3U564 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dcp1bQ3U564 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dcp1bQ3U564 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dcp1bQ3U564 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dcp1bQ3U564 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Dcp1bQ3U564 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dcp1bQ3U564 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dcp1bQ3U564 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dcp1bQ3U564 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dcp1bQ3U564 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dcp1bQ3U564 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dcp1bQ3U564 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dcp1bQ3U564 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dcp1bQ3U564 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dcp1bQ3U564 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dcp1bQ3U564 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dcp1bQ3U564 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dcp1bQ3U564 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dcp1bQ3U564 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dcp1bQ3U564 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dcp1bQ3U564 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dcp1bQ3U564 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dcp1bQ3U564 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dcp1bQ3U564 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dcp1bQ3U564 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dcp1bQ3U564 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dcp1bQ3U564 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dcp1bQ3U564 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dcp1bQ3U564 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dcp1bQ3U564 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dcp1bQ3U564 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dcp1bQ3U564 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dcp1bQ3U564 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dcp1bQ3U564 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dcp1bQ3U564 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dcp1bQ3U564 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dcp1bQ3U564 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dcp1bQ3U564 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Dcp1bQ3U564 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dcp1bQ3U564 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dcp1bQ3U564 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dcp1bQ3U564 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dcp1bQ3U564 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dcp1bQ3U564 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dcp1bQ3U564 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dcp1bQ3U564 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dcp1bQ3U564 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dcp1bQ3U564 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dcp1bQ3U564 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dcp1bQ3U564 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dcp1bQ3U564 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dcp1bQ3U564 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dcp1bQ3U564 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dcp1bQ3U564 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dcp1bQ3U564 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dcp1bQ3U564 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dcp1bQ3U564 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dcp1bQ3U564 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Dcp1bQ3U564 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcp1bQ3U564 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcp1bQ3U564 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcp1bQ3U564 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dcp1bQ3U564 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcp1bQ3U564 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcp1bQ3U564 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dcp1bQ3U564 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcp1bQ3U564 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcp1bQ3U564 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcp1bQ3U564 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcp1bQ3U564 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dcp1bQ3U564 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dcp1bQ3U564 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dcp1bQ3U564 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Dcp1bQ3U564 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dcp1bQ3U564 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dcp1bQ3U564 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dcp1bQ3U564 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Dcp1bQ3U564 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dcp1bQ3U564 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dcp1bQ3U564 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dcp1bQ3U564 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dcp1bQ3U564 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dcp1bQ3U564 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Dcp1bQ3U564 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dcp1bQ3U564 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dcp1bQ3U564 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dcp1bQ3U564 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dcp1bQ3U564 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dcp1bQ3U564 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dcp1bQ3U564 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms