Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrn4clQ3TYX2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrn4clQ3TYX2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrn4clQ3TYX2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrn4clQ3TYX2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrn4clQ3TYX2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrn4clQ3TYX2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrn4clQ3TYX2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrn4clQ3TYX2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrn4clQ3TYX2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrn4clQ3TYX2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrn4clQ3TYX2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrn4clQ3TYX2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrn4clQ3TYX2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrn4clQ3TYX2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrn4clQ3TYX2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrn4clQ3TYX2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrn4clQ3TYX2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrn4clQ3TYX2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lrrn4clQ3TYX2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrn4clQ3TYX2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrn4clQ3TYX2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrrn4clQ3TYX2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrn4clQ3TYX2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrn4clQ3TYX2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrn4clQ3TYX2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrn4clQ3TYX2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrn4clQ3TYX2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrn4clQ3TYX2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrn4clQ3TYX2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrn4clQ3TYX2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrn4clQ3TYX2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lrrn4clQ3TYX2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrn4clQ3TYX2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrn4clQ3TYX2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrn4clQ3TYX2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrn4clQ3TYX2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrn4clQ3TYX2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrn4clQ3TYX2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrn4clQ3TYX2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrn4clQ3TYX2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrn4clQ3TYX2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrn4clQ3TYX2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrn4clQ3TYX2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrn4clQ3TYX2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrn4clQ3TYX2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrn4clQ3TYX2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrn4clQ3TYX2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrn4clQ3TYX2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrn4clQ3TYX2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrn4clQ3TYX2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrn4clQ3TYX2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrn4clQ3TYX2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrn4clQ3TYX2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrn4clQ3TYX2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrn4clQ3TYX2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrn4clQ3TYX2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrn4clQ3TYX2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrn4clQ3TYX2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrn4clQ3TYX2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrn4clQ3TYX2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrn4clQ3TYX2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrn4clQ3TYX2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrn4clQ3TYX2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrn4clQ3TYX2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrn4clQ3TYX2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrn4clQ3TYX2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrn4clQ3TYX2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrn4clQ3TYX2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrn4clQ3TYX2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrn4clQ3TYX2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrn4clQ3TYX2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrn4clQ3TYX2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrn4clQ3TYX2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrn4clQ3TYX2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrn4clQ3TYX2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms