Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Jmjd8Q3TA59 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Jmjd8Q3TA59 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Jmjd8Q3TA59 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Jmjd8Q3TA59 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Jmjd8Q3TA59 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Jmjd8Q3TA59 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Jmjd8Q3TA59 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Jmjd8Q3TA59 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Jmjd8Q3TA59 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Jmjd8Q3TA59 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Jmjd8Q3TA59 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Jmjd8Q3TA59 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Jmjd8Q3TA59 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Jmjd8Q3TA59 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Jmjd8Q3TA59 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Jmjd8Q3TA59 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd8Q3TA59 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jmjd8Q3TA59 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jmjd8Q3TA59 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Jmjd8Q3TA59 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jmjd8Q3TA59 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Jmjd8Q3TA59 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Jmjd8Q3TA59 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Jmjd8Q3TA59 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Jmjd8Q3TA59 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jmjd8Q3TA59 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Jmjd8Q3TA59 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Jmjd8Q3TA59 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd8Q3TA59 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Jmjd8Q3TA59 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd8Q3TA59 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Jmjd8Q3TA59 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Jmjd8Q3TA59 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Jmjd8Q3TA59 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Jmjd8Q3TA59 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Jmjd8Q3TA59 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Jmjd8Q3TA59 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Jmjd8Q3TA59 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Jmjd8Q3TA59 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Jmjd8Q3TA59 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Jmjd8Q3TA59 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jmjd8Q3TA59 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jmjd8Q3TA59 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Jmjd8Q3TA59 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Jmjd8Q3TA59 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Jmjd8Q3TA59 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Jmjd8Q3TA59 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd8Q3TA59 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd8Q3TA59 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jmjd8Q3TA59 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd8Q3TA59 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jmjd8Q3TA59 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jmjd8Q3TA59 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd8Q3TA59 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Jmjd8Q3TA59 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jmjd8Q3TA59 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Jmjd8Q3TA59 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jmjd8Q3TA59 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jmjd8Q3TA59 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Jmjd8Q3TA59 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Jmjd8Q3TA59 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Jmjd8Q3TA59 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Jmjd8Q3TA59 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jmjd8Q3TA59 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Jmjd8Q3TA59 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd8Q3TA59 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Jmjd8Q3TA59 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd8Q3TA59 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Jmjd8Q3TA59 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jmjd8Q3TA59 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd8Q3TA59 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jmjd8Q3TA59 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd8Q3TA59 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Jmjd8Q3TA59 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd8Q3TA59 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jmjd8Q3TA59 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jmjd8Q3TA59 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jmjd8Q3TA59 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd8Q3TA59 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Jmjd8Q3TA59 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Jmjd8Q3TA59 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jmjd8Q3TA59 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Jmjd8Q3TA59 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Jmjd8Q3TA59 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Jmjd8Q3TA59 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Jmjd8Q3TA59 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Jmjd8Q3TA59 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Jmjd8Q3TA59 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Jmjd8Q3TA59 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Jmjd8Q3TA59 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Jmjd8Q3TA59 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Jmjd8Q3TA59 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Jmjd8Q3TA59 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Jmjd8Q3TA59 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Jmjd8Q3TA59 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Jmjd8Q3TA59 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Jmjd8Q3TA59 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Jmjd8Q3TA59 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms