Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Spatc1Q148B6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Spatc1Q148B6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Spatc1Q148B6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Spatc1Q148B6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Spatc1Q148B6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spatc1Q148B6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spatc1Q148B6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spatc1Q148B6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spatc1Q148B6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Spatc1Q148B6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spatc1Q148B6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spatc1Q148B6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spatc1Q148B6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spatc1Q148B6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spatc1Q148B6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spatc1Q148B6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spatc1Q148B6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spatc1Q148B6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spatc1Q148B6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spatc1Q148B6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Spatc1Q148B6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spatc1Q148B6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spatc1Q148B6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Spatc1Q148B6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spatc1Q148B6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spatc1Q148B6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spatc1Q148B6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spatc1Q148B6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spatc1Q148B6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spatc1Q148B6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spatc1Q148B6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spatc1Q148B6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spatc1Q148B6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spatc1Q148B6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spatc1Q148B6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Spatc1Q148B6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spatc1Q148B6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spatc1Q148B6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spatc1Q148B6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spatc1Q148B6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spatc1Q148B6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spatc1Q148B6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spatc1Q148B6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spatc1Q148B6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spatc1Q148B6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Spatc1Q148B6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spatc1Q148B6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spatc1Q148B6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spatc1Q148B6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spatc1Q148B6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spatc1Q148B6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spatc1Q148B6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spatc1Q148B6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spatc1Q148B6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spatc1Q148B6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spatc1Q148B6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spatc1Q148B6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spatc1Q148B6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spatc1Q148B6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spatc1Q148B6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spatc1Q148B6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spatc1Q148B6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spatc1Q148B6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spatc1Q148B6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spatc1Q148B6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spatc1Q148B6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spatc1Q148B6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spatc1Q148B6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spatc1Q148B6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spatc1Q148B6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spatc1Q148B6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spatc1Q148B6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spatc1Q148B6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spatc1Q148B6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spatc1Q148B6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spatc1Q148B6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spatc1Q148B6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spatc1Q148B6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spatc1Q148B6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Spatc1Q148B6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Spatc1Q148B6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spatc1Q148B6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spatc1Q148B6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spatc1Q148B6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Spatc1Q148B6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Spatc1Q148B6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spatc1Q148B6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spatc1Q148B6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spatc1Q148B6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spatc1Q148B6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spatc1Q148B6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spatc1Q148B6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Spatc1Q148B6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spatc1Q148B6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spatc1Q148B6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spatc1Q148B6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spatc1Q148B6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spatc1Q148B6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spatc1Q148B6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms