Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrkcqQ02111 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PrkcqQ02111 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PrkcqQ02111 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PrkcqQ02111 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrkcqQ02111 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PrkcqQ02111 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrkcqQ02111 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrkcqQ02111 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrkcqQ02111 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrkcqQ02111 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrkcqQ02111 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrkcqQ02111 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrkcqQ02111 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrkcqQ02111 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrkcqQ02111 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrkcqQ02111 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrkcqQ02111 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrkcqQ02111 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrkcqQ02111 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PrkcqQ02111 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrkcqQ02111 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PrkcqQ02111 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrkcqQ02111 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrkcqQ02111 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrkcqQ02111 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrkcqQ02111 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrkcqQ02111 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrkcqQ02111 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrkcqQ02111 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PrkcqQ02111 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrkcqQ02111 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrkcqQ02111 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrkcqQ02111 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrkcqQ02111 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrkcqQ02111 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrkcqQ02111 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PrkcqQ02111 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrkcqQ02111 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrkcqQ02111 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrkcqQ02111 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PrkcqQ02111 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PrkcqQ02111 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrkcqQ02111 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrkcqQ02111 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrkcqQ02111 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PrkcqQ02111 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrkcqQ02111 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrkcqQ02111 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PrkcqQ02111 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrkcqQ02111 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrkcqQ02111 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrkcqQ02111 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrkcqQ02111 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PrkcqQ02111 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrkcqQ02111 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrkcqQ02111 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrkcqQ02111 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PrkcqQ02111 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PrkcqQ02111 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PrkcqQ02111 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PrkcqQ02111 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PrkcqQ02111 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PrkcqQ02111 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PrkcqQ02111 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PrkcqQ02111 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcqQ02111 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcqQ02111 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcqQ02111 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PrkcqQ02111 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PrkcqQ02111 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PrkcqQ02111 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PrkcqQ02111 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrkcqQ02111 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrkcqQ02111 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PrkcqQ02111 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrkcqQ02111 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PrkcqQ02111 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PrkcqQ02111 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PrkcqQ02111 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcqQ02111 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcqQ02111 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcqQ02111 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PrkcqQ02111 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PrkcqQ02111 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PrkcqQ02111 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PrkcqQ02111 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrkcqQ02111 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PrkcqQ02111 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PrkcqQ02111 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrkcqQ02111 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PrkcqQ02111 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkcqQ02111 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PrkcqQ02111 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PrkcqQ02111 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcqQ02111 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcqQ02111 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PrkcqQ02111 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrkcqQ02111 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrkcqQ02111 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms