Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rps3aP97351 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rps3aP97351 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps3aP97351 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rps3aP97351 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps3aP97351 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rps3aP97351 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps3aP97351 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps3aP97351 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps3aP97351 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps3aP97351 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps3aP97351 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rps3aP97351 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps3aP97351 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps3aP97351 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rps3aP97351 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rps3aP97351 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rps3aP97351 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps3aP97351 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rps3aP97351 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rps3aP97351 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rps3aP97351 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rps3aP97351 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rps3aP97351 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps3aP97351 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rps3aP97351 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rps3aP97351 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rps3aP97351 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps3aP97351 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps3aP97351 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rps3aP97351 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rps3aP97351 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rps3aP97351 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rps3aP97351 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rps3aP97351 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps3aP97351 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps3aP97351 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rps3aP97351 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rps3aP97351 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rps3aP97351 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rps3aP97351 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps3aP97351 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps3aP97351 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps3aP97351 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps3aP97351 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rps3aP97351 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rps3aP97351 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps3aP97351 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rps3aP97351 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps3aP97351 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps3aP97351 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps3aP97351 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps3aP97351 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps3aP97351 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps3aP97351 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps3aP97351 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps3aP97351 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps3aP97351 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps3aP97351 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps3aP97351 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps3aP97351 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps3aP97351 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps3aP97351 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps3aP97351 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rps3aP97351 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rps3aP97351 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rps3aP97351 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps3aP97351 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rps3aP97351 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps3aP97351 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps3aP97351 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rps3aP97351 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps3aP97351 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rps3aP97351 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rps3aP97351 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rps3aP97351 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps3aP97351 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps3aP97351 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps3aP97351 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps3aP97351 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps3aP97351 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps3aP97351 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps3aP97351 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps3aP97351 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps3aP97351 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps3aP97351 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps3aP97351 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps3aP97351 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps3aP97351 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps3aP97351 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps3aP97351 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps3aP97351 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps3aP97351 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps3aP97351 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps3aP97351 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps3aP97351 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps3aP97351 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps3aP97351 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps3aP97351 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rps3aP97351 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms