Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim43bP86448 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trim43bP86448 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trim43bP86448 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trim43bP86448 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trim43bP86448 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trim43bP86448 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trim43bP86448 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim43bP86448 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trim43bP86448 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Trim43bP86448 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim43bP86448 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trim43bP86448 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trim43bP86448 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trim43bP86448 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trim43bP86448 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trim43bP86448 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim43bP86448 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trim43bP86448 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim43bP86448 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trim43bP86448 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trim43bP86448 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim43bP86448 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim43bP86448 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trim43bP86448 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim43bP86448 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim43bP86448 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trim43bP86448 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim43bP86448 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim43bP86448 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Trim43bP86448 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim43bP86448 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim43bP86448 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim43bP86448 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim43bP86448 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim43bP86448 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim43bP86448 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim43bP86448 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim43bP86448 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim43bP86448 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim43bP86448 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim43bP86448 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim43bP86448 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim43bP86448 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim43bP86448 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim43bP86448 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim43bP86448 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim43bP86448 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim43bP86448 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim43bP86448 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim43bP86448 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim43bP86448 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim43bP86448 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim43bP86448 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim43bP86448 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim43bP86448 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim43bP86448 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim43bP86448 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim43bP86448 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim43bP86448 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim43bP86448 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim43bP86448 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim43bP86448 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim43bP86448 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim43bP86448 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim43bP86448 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trim43bP86448 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trim43bP86448 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim43bP86448 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim43bP86448 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim43bP86448 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim43bP86448 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim43bP86448 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim43bP86448 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim43bP86448 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim43bP86448 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim43bP86448 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim43bP86448 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim43bP86448 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim43bP86448 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim43bP86448 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim43bP86448 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim43bP86448 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim43bP86448 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim43bP86448 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim43bP86448 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim43bP86448 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim43bP86448 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim43bP86448 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim43bP86448 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms